Protein–RNA interactions for Protein: P20664

Prim1, DNA primase small subunit, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prim1P20664 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Trmt10b-202ENSMUST00000107800 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Olfr1118-201ENSMUST00000121296 996 ntAPPRIS P2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Gm6027-201ENSMUST00000121467 756 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Mnd1-ps-201ENSMUST00000162462 604 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Gm3573-201ENSMUST00000168673 898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Olfml3-204ENSMUST00000169286 874 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Gm3486-201ENSMUST00000169361 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Gm4181-201ENSMUST00000170249 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Gm26134-201ENSMUST00000178484 110 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Gm20778-201ENSMUST00000178524 627 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Calm5-202ENSMUST00000184271 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Ptma-202ENSMUST00000186255 768 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Gm42816-201ENSMUST00000198433 325 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Gm44759-201ENSMUST00000206057 430 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Gm45338-201ENSMUST00000209198 820 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Gm20063-201ENSMUST00000220757 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prim1P20664 4930480M12Rik-201ENSMUST00000221084 550 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Cinp-204ENSMUST00000221102 536 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prim1P20664 AC165154.1-201ENSMUST00000226661 340 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Fam212a-201ENSMUST00000048568 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Taar8b-201ENSMUST00000092654 1035 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prim1P20664 1700036A12Rik-202ENSMUST00000190053 1828 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Gm12788-201ENSMUST00000119090 308 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Csf1-204ENSMUST00000120654 821 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Gm13487-201ENSMUST00000122240 864 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Nhp2-202ENSMUST00000127405 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Gm15507-201ENSMUST00000133523 592 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prim1P20664 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Fam3a-201ENSMUST00000015427 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Prim1P20664 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Gm30946-201ENSMUST00000198288 724 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Gm8615-202ENSMUST00000201946 737 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Gm45758-201ENSMUST00000212448 1006 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Nmi-201ENSMUST00000028314 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Nudt2-201ENSMUST00000030154 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Fpr-rs3-201ENSMUST00000071189 1032 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Gm16380-201ENSMUST00000077997 478 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Sertad3-201ENSMUST00000068641 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Sparc-207ENSMUST00000213866 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prim1P20664 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prim1P20664 2610524H06Rik-201ENSMUST00000100850 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Gm13625-201ENSMUST00000149283 480 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Vmn1r169-201ENSMUST00000170290 915 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Gm28351-201ENSMUST00000186261 559 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Gm6657-203ENSMUST00000188791 531 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prim1P20664 Gm37284-201ENSMUST00000193607 539 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms