Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Gm35021-201ENSMUST00000210105 2329 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 C130060K24Rik-203ENSMUST00000170608 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Gm45878-201ENSMUST00000211839 241 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Vmn1r8-201ENSMUST00000078186 1213 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Camk2g-201ENSMUST00000071816 3703 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 4931406C07Rik-201ENSMUST00000034414 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Pla2g6-203ENSMUST00000172403 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Cd19-201ENSMUST00000032968 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Lao1-201ENSMUST00000058651 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
PdgfaP20033 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Vstm2a-201ENSMUST00000109645 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Trp53inp2-201ENSMUST00000043237 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Recql-202ENSMUST00000100832 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Trdn-202ENSMUST00000217779 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Gm6714-201ENSMUST00000218677 2330 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Gm17540-201ENSMUST00000181617 1528 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Uhrf1-202ENSMUST00000113035 3402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Ncam1-203ENSMUST00000192584 2525 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Ppp4r1l-ps-202ENSMUST00000132669 2767 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Abhd4-201ENSMUST00000041197 2401 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Sez6l-206ENSMUST00000212758 2664 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Ezr-201ENSMUST00000064234 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 6430562O15Rik-201ENSMUST00000180491 2488 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PdgfaP20033 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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