Protein–RNA interactions for Protein: P19137

Lama1, Laminin subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 3,084 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lama1P19137 Gm12136-201ENSMUST00000120460 1209 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Lama1P19137 4933438A12Rik-201ENSMUST00000144579 1013 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lama1P19137 Gm5766-202ENSMUST00000161633 799 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Lama1P19137 Gm17147-201ENSMUST00000164176 432 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Lama1P19137 Sectm1b-206ENSMUST00000168459 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lama1P19137 Gm20610-201ENSMUST00000176406 587 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lama1P19137 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lama1P19137 AC153153.1-201ENSMUST00000225803 793 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Lama1P19137 AC133499.1-201ENSMUST00000227778 1097 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lama1P19137 Gm16477-201ENSMUST00000085365 801 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Lama1P19137 Gm17415-201ENSMUST00000096427 789 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Lama1P19137 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lama1P19137 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Lama1P19137 Spata7-202ENSMUST00000101144 1541 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lama1P19137 Gm38246-201ENSMUST00000194318 1511 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Lama1P19137 Avil-203ENSMUST00000129173 2925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lama1P19137 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lama1P19137 Cap2-202ENSMUST00000119341 2454 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lama1P19137 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lama1P19137 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lama1P19137 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lama1P19137 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lama1P19137 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lama1P19137 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lama1P19137 Agbl4-203ENSMUST00000106587 2631 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lama1P19137 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Lama1P19137 Stamos-201ENSMUST00000152524 801 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lama1P19137 Gm32102-201ENSMUST00000196885 241 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Lama1P19137 Gm40153-201ENSMUST00000197904 637 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lama1P19137 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Lama1P19137 Itgax-203ENSMUST00000205460 1215 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lama1P19137 Gm31378-201ENSMUST00000213538 267 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lama1P19137 Gm31374-201ENSMUST00000213885 619 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lama1P19137 AC154806.7-201ENSMUST00000227998 202 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Lama1P19137 3110009E18Rik-201ENSMUST00000027637 1007 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lama1P19137 Mcu-201ENSMUST00000009791 1079 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lama1P19137 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lama1P19137 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lama1P19137 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Lama1P19137 Lrrc4-201ENSMUST00000062304 3615 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lama1P19137 AA474408-201ENSMUST00000098110 3339 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Lama1P19137 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lama1P19137 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lama1P19137 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lama1P19137 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Lama1P19137 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Lama1P19137 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Lama1P19137 Rffl-201ENSMUST00000021036 1719 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Lama1P19137 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Lama1P19137 Pmp22-201ENSMUST00000018361 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Lama1P19137 Arhgap24-203ENSMUST00000094559 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Lama1P19137 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Lama1P19137 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Lama1P19137 Pigc-205ENSMUST00000193784 4207 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Lama1P19137 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Lama1P19137 Gm15419-201ENSMUST00000148654 743 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Lama1P19137 Gm13780-201ENSMUST00000150482 1187 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Lama1P19137 Gm28391-201ENSMUST00000185202 379 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Lama1P19137 Gm29528-201ENSMUST00000186699 379 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Lama1P19137 Gm29526-201ENSMUST00000187217 379 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Lama1P19137 Gm19058-201ENSMUST00000192135 598 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Lama1P19137 Ighv5-1-201ENSMUST00000193324 353 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Lama1P19137 Hyal2-206ENSMUST00000195681 2968 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Lama1P19137 Gm5845-201ENSMUST00000195812 796 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Lama1P19137 Gm42133-201ENSMUST00000196076 637 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Lama1P19137 Gm42859-201ENSMUST00000199572 193 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Lama1P19137 Gm2566-201ENSMUST00000201267 431 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Lama1P19137 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Lama1P19137 Lsm3-205ENSMUST00000206947 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Lama1P19137 Gm10689-201ENSMUST00000098864 432 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Lama1P19137 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Lama1P19137 Gm5766-201ENSMUST00000160520 1977 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Lama1P19137 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Lama1P19137 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Lama1P19137 Ank2-214ENSMUST00000182547 2428 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Lama1P19137 Tcl1b4-202ENSMUST00000222867 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Lama1P19137 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Lama1P19137 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Lama1P19137 4833420G17Rik-201ENSMUST00000026519 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Lama1P19137 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Lama1P19137 Igsf5-201ENSMUST00000000163 1851 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Lama1P19137 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Lama1P19137 Gpsm1-201ENSMUST00000066889 3432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Lama1P19137 Gm12947-201ENSMUST00000116114 420 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Lama1P19137 Gm12254-201ENSMUST00000134617 471 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Lama1P19137 Gm15341-201ENSMUST00000137315 592 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Lama1P19137 Tcl1-203ENSMUST00000175652 535 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Lama1P19137 Gm28746-201ENSMUST00000187453 380 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Lama1P19137 AC102312.1-202ENSMUST00000218600 851 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Lama1P19137 Gm18504-201ENSMUST00000220917 929 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Lama1P19137 Gm5191-201ENSMUST00000222882 1236 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Lama1P19137 AC107711.3-201ENSMUST00000228939 1035 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Lama1P19137 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Lama1P19137 Rnf6-206ENSMUST00000161859 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Lama1P19137 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Lama1P19137 Dnajc14-202ENSMUST00000217745 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Lama1P19137 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Lama1P19137 Sun1-201ENSMUST00000058716 4134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Lama1P19137 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Lama1P19137 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms