Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Casq2-201ENSMUST00000029454 2556 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Vmn2r18-201ENSMUST00000165928 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Trim2-205ENSMUST00000107693 5755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Ccdc148-204ENSMUST00000226455 4612 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Bora-201ENSMUST00000022656 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Greb1-201ENSMUST00000048064 7940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Adamts4-203ENSMUST00000219033 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Unc45a-202ENSMUST00000107368 3635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Pknox1-201ENSMUST00000097352 4172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Mms19-201ENSMUST00000026168 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Arsb-201ENSMUST00000091403 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Klhl22-202ENSMUST00000120488 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Gm13497-201ENSMUST00000139497 2038 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Olfr130-203ENSMUST00000217390 5959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Kcnk5-201ENSMUST00000024011 3392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Entpd5-206ENSMUST00000122194 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Tctex1d1-205ENSMUST00000140654 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Pcdhga5-201ENSMUST00000193414 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Rpl18-207ENSMUST00000210640 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Arhgap25-201ENSMUST00000071024 2635 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Ppp1r17-201ENSMUST00000052827 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Rnf144b-201ENSMUST00000068891 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Arfgef3-201ENSMUST00000019999 5606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Adamdec1-201ENSMUST00000022641 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Kat7-205ENSMUST00000107734 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Zbtb25-202ENSMUST00000176102 2707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Cbr4-201ENSMUST00000034058 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Abcf1-201ENSMUST00000043757 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 9430064I24Rik-201ENSMUST00000206516 2669 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Tacc2-208ENSMUST00000207549 3492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Zbtb18-201ENSMUST00000077225 4944 ntAPPRIS P3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Ahnak2-201ENSMUST00000101010 2821 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Astn1-201ENSMUST00000046110 7195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Rora-201ENSMUST00000034766 10878 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Pla2g4e-201ENSMUST00000090071 4477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Zfp352-202ENSMUST00000107129 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Gm43457-201ENSMUST00000200867 2409 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Pou6f1-204ENSMUST00000176271 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Gm43615-201ENSMUST00000197465 1773 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 AC156802.2-203ENSMUST00000226032 1906 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Vpreb1P13372 Gm35715-201ENSMUST00000197421 2054 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.3 ms