Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Ano10-203ENSMUST00000214409 2384 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Gfra2-201ENSMUST00000022699 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Eps8l1-204ENSMUST00000163893 3868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Dyrk4-202ENSMUST00000078521 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Apbb1-217ENSMUST00000191011 2712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Fam83a-202ENSMUST00000160942 2876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Rnf144b-201ENSMUST00000068891 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Ppat-202ENSMUST00000140076 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 D630003M21Rik-201ENSMUST00000046944 3910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 C530044C16Rik-201ENSMUST00000204275 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Fam234b-201ENSMUST00000111915 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Slc23a2-201ENSMUST00000028815 6364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Gm44369-201ENSMUST00000204543 2175 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Scamp2-201ENSMUST00000045791 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Trim16-202ENSMUST00000072639 1929 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Bcl11a-204ENSMUST00000118955 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Rufy2-202ENSMUST00000119567 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Usp17le-202ENSMUST00000211384 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Slc29a3-201ENSMUST00000117513 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Rad1-202ENSMUST00000100775 4085 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Adam8-202ENSMUST00000106069 3117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Adam8-201ENSMUST00000026546 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Mettl14-204ENSMUST00000174323 4202 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Ints10-201ENSMUST00000034328 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Gm10848-201ENSMUST00000192361 1811 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Ppil2-202ENSMUST00000115719 838 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Ndrg4-203ENSMUST00000080666 2738 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Akap3-202ENSMUST00000202574 2879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Lpin3-204ENSMUST00000109457 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Gm11033-203ENSMUST00000156185 2321 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Ccdc96-201ENSMUST00000060100 3585 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Eef1a1-201ENSMUST00000042235 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Phc1-204ENSMUST00000159252 3744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
H2-Eb1P04230 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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