Protein–RNA interactions for Protein: O88940

Msc, Musculin, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MscO88940 Pabpc1l-201ENSMUST00000067715 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
MscO88940 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
MscO88940 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
MscO88940 Gm5308-201ENSMUST00000196752 1354 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
MscO88940 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
MscO88940 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
MscO88940 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
MscO88940 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
MscO88940 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
MscO88940 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
MscO88940 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
MscO88940 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
MscO88940 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
MscO88940 Gm5739-201ENSMUST00000208601 1703 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
MscO88940 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
MscO88940 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
MscO88940 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
MscO88940 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
MscO88940 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
MscO88940 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
MscO88940 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
MscO88940 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
MscO88940 Clcc1-202ENSMUST00000106609 2043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
MscO88940 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
MscO88940 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
MscO88940 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
MscO88940 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
MscO88940 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
MscO88940 Trmt10b-202ENSMUST00000107800 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
MscO88940 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
MscO88940 Gm11269-201ENSMUST00000157011 595 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
MscO88940 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
MscO88940 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
MscO88940 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
MscO88940 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
MscO88940 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
MscO88940 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
MscO88940 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
MscO88940 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
MscO88940 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
MscO88940 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
MscO88940 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
MscO88940 Gm35025-203ENSMUST00000193519 634 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
MscO88940 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
MscO88940 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
MscO88940 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
MscO88940 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
MscO88940 Gm17749-201ENSMUST00000216282 690 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
MscO88940 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
MscO88940 AC122346.3-201ENSMUST00000223983 306 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
MscO88940 AC122035.1-201ENSMUST00000227576 1016 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
MscO88940 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
MscO88940 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
MscO88940 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
MscO88940 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
MscO88940 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
MscO88940 Eif3d-201ENSMUST00000100484 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
MscO88940 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
MscO88940 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
MscO88940 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
MscO88940 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
MscO88940 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
MscO88940 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
MscO88940 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
MscO88940 1500002C15Rik-201ENSMUST00000178987 2183 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
MscO88940 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
MscO88940 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
MscO88940 Rufy2-202ENSMUST00000119567 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
MscO88940 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
MscO88940 Tsc22d3-201ENSMUST00000055738 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
MscO88940 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
MscO88940 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
MscO88940 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
MscO88940 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
MscO88940 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
MscO88940 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
MscO88940 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
MscO88940 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
MscO88940 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
MscO88940 Ltc4s-201ENSMUST00000101265 480 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
MscO88940 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
MscO88940 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
MscO88940 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
MscO88940 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
MscO88940 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
MscO88940 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
MscO88940 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
MscO88940 Gm7929-201ENSMUST00000178711 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
MscO88940 Gm3015-202ENSMUST00000179803 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
MscO88940 Sbsn-205ENSMUST00000182721 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
MscO88940 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
MscO88940 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
MscO88940 Platr10-202ENSMUST00000191479 818 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
MscO88940 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
MscO88940 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
MscO88940 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
MscO88940 Fth1-201ENSMUST00000025563 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
MscO88940 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
MscO88940 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
MscO88940 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms