Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 Cntn4-203ENSMUST00000113258 2464 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 Synpr-201ENSMUST00000070323 2541 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 Ccdc191-201ENSMUST00000122014 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
Lnx1O70263 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 Arhgef9-201ENSMUST00000113873 2117 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 Lsamp-201ENSMUST00000078873 2951 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 Atxn7l1-204ENSMUST00000125192 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.4 ms