Protein–RNA interactions for Protein: O55028

Bckdk, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, mousemouse

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Length 412 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdkO55028 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
BckdkO55028 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
BckdkO55028 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
BckdkO55028 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Erlin2-201ENSMUST00000033873 4838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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BckdkO55028 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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BckdkO55028 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
BckdkO55028 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Arid2-201ENSMUST00000096250 8507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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BckdkO55028 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
BckdkO55028 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Gm21103-202ENSMUST00000170923 1761 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
BckdkO55028 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
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BckdkO55028 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
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BckdkO55028 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
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BckdkO55028 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
BckdkO55028 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
BckdkO55028 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
BckdkO55028 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
BckdkO55028 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
BckdkO55028 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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