Protein–RNA interactions for Protein: J3QPX5

Gm8888, Predicted gene 8888, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8888J3QPX5 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm8888J3QPX5 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm8888J3QPX5 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm8888J3QPX5 Cd55-201ENSMUST00000027650 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm8888J3QPX5 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm8888J3QPX5 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm8888J3QPX5 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm8888J3QPX5 Abl2-202ENSMUST00000166172 10151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm8888J3QPX5 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm8888J3QPX5 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm8888J3QPX5 Wbp1l-204ENSMUST00000138302 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm8888J3QPX5 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm8888J3QPX5 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm8888J3QPX5 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm8888J3QPX5 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm8888J3QPX5 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm8888J3QPX5 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm8888J3QPX5 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm8888J3QPX5 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm8888J3QPX5 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm8888J3QPX5 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm8888J3QPX5 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm8888J3QPX5 Ighv1-81-201ENSMUST00000103548 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm8888J3QPX5 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm8888J3QPX5 1700037C06Rik-201ENSMUST00000132824 874 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm8888J3QPX5 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm8888J3QPX5 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm8888J3QPX5 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm8888J3QPX5 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm8888J3QPX5 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm8888J3QPX5 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm8888J3QPX5 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm8888J3QPX5 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm8888J3QPX5 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm8888J3QPX5 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm8888J3QPX5 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm8888J3QPX5 Rbfox2-203ENSMUST00000166610 6573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm8888J3QPX5 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm8888J3QPX5 Ccdc191-201ENSMUST00000122014 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm8888J3QPX5 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm8888J3QPX5 Ptpn21-202ENSMUST00000170188 5562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm8888J3QPX5 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm8888J3QPX5 Polq-202ENSMUST00000071452 7290 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm8888J3QPX5 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm8888J3QPX5 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm8888J3QPX5 Ppp6r3-203ENSMUST00000172362 4633 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm8888J3QPX5 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm8888J3QPX5 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm8888J3QPX5 Tmc5-203ENSMUST00000121715 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm8888J3QPX5 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm8888J3QPX5 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm8888J3QPX5 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm8888J3QPX5 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm8888J3QPX5 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm8888J3QPX5 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm8888J3QPX5 Pml-202ENSMUST00000114136 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm8888J3QPX5 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm8888J3QPX5 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm8888J3QPX5 Dip2a-205ENSMUST00000160048 6551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm8888J3QPX5 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm8888J3QPX5 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm8888J3QPX5 Sec24d-201ENSMUST00000047923 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm8888J3QPX5 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm8888J3QPX5 Madd-202ENSMUST00000066473 5974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm8888J3QPX5 Gm6793-201ENSMUST00000071732 1604 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm8888J3QPX5 Cer1-201ENSMUST00000048430 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm8888J3QPX5 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm8888J3QPX5 Nipbl-201ENSMUST00000052965 8815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm8888J3QPX5 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm8888J3QPX5 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm8888J3QPX5 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm8888J3QPX5 AC155245.1-201ENSMUST00000222266 1804 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm8888J3QPX5 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm8888J3QPX5 Scyl2-204ENSMUST00000174252 4817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm8888J3QPX5 Phip-201ENSMUST00000034787 10756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm8888J3QPX5 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm8888J3QPX5 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm8888J3QPX5 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm8888J3QPX5 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm8888J3QPX5 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm8888J3QPX5 Gm8876-201ENSMUST00000120768 1122 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm8888J3QPX5 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm8888J3QPX5 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm8888J3QPX5 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm8888J3QPX5 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm8888J3QPX5 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm8888J3QPX5 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm8888J3QPX5 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm8888J3QPX5 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm8888J3QPX5 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm8888J3QPX5 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm8888J3QPX5 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm8888J3QPX5 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm8888J3QPX5 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm8888J3QPX5 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm8888J3QPX5 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm8888J3QPX5 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm8888J3QPX5 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm8888J3QPX5 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm8888J3QPX5 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms