Protein–RNA interactions for Protein: J3QPD3

Gm8356, Predicted gene 8356, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8356J3QPD3 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Gm8356J3QPD3 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Gm8356J3QPD3 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Gm8356J3QPD3 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Gm8356J3QPD3 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Gm8356J3QPD3 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Gm8356J3QPD3 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Gm8356J3QPD3 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Gm8356J3QPD3 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Gm8356J3QPD3 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Gm8356J3QPD3 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Gm8356J3QPD3 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Gm8356J3QPD3 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Gm8356J3QPD3 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Gm8356J3QPD3 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Gm8356J3QPD3 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Gm8356J3QPD3 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Gm8356J3QPD3 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Gm8356J3QPD3 Cyp2b10-202ENSMUST00000072438 1916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Gm8356J3QPD3 Ar-201ENSMUST00000052837 10048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Gm8356J3QPD3 Trim65-202ENSMUST00000106440 4040 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Gm8356J3QPD3 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Gm8356J3QPD3 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Gm8356J3QPD3 Sirpa-201ENSMUST00000049262 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Gm8356J3QPD3 Riok3-201ENSMUST00000025270 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Gm8356J3QPD3 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Gm8356J3QPD3 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Gm8356J3QPD3 Cdkl5-205ENSMUST00000198931 9796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Gm8356J3QPD3 Tasp1-203ENSMUST00000110079 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Gm8356J3QPD3 Ank1-206ENSMUST00000117662 6257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Gm8356J3QPD3 Gm37806-201ENSMUST00000194524 6387 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Gm8356J3QPD3 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Gm8356J3QPD3 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Gm8356J3QPD3 G3bp1-201ENSMUST00000018727 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Gm8356J3QPD3 Gm28693-201ENSMUST00000189622 2638 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm8356J3QPD3 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm8356J3QPD3 Smok3a-201ENSMUST00000085886 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm8356J3QPD3 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm8356J3QPD3 Mpp4-203ENSMUST00000114275 2982 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm8356J3QPD3 Ldb3-205ENSMUST00000090040 4981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm8356J3QPD3 Tank-203ENSMUST00000112495 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm8356J3QPD3 Cnot8-202ENSMUST00000108843 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm8356J3QPD3 Mkx-201ENSMUST00000079788 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm8356J3QPD3 Mcf2l-202ENSMUST00000098927 3215 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm8356J3QPD3 Arhgap24-203ENSMUST00000094559 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm8356J3QPD3 Ccdc93-202ENSMUST00000112621 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm8356J3QPD3 CK137956-201ENSMUST00000030614 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm8356J3QPD3 Ncoa1-209ENSMUST00000220434 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm8356J3QPD3 Camk1g-201ENSMUST00000016323 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm8356J3QPD3 Csnk1g1-214ENSMUST00000206594 2482 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm8356J3QPD3 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm8356J3QPD3 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm8356J3QPD3 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm8356J3QPD3 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm8356J3QPD3 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm8356J3QPD3 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm8356J3QPD3 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm8356J3QPD3 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm8356J3QPD3 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm8356J3QPD3 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm8356J3QPD3 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm8356J3QPD3 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm8356J3QPD3 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm8356J3QPD3 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm8356J3QPD3 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm8356J3QPD3 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm8356J3QPD3 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm8356J3QPD3 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm8356J3QPD3 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm8356J3QPD3 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm8356J3QPD3 Cspg4-201ENSMUST00000035661 8121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm8356J3QPD3 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm8356J3QPD3 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm8356J3QPD3 Pigk-204ENSMUST00000159899 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm8356J3QPD3 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm8356J3QPD3 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm8356J3QPD3 Dclk2-209ENSMUST00000195561 3486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm8356J3QPD3 Heatr6-201ENSMUST00000001002 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm8356J3QPD3 Kcnj9-201ENSMUST00000062387 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm8356J3QPD3 Svil-203ENSMUST00000126977 7907 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm8356J3QPD3 Nod1-202ENSMUST00000168172 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm8356J3QPD3 Tubb2b-201ENSMUST00000075774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm8356J3QPD3 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm8356J3QPD3 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Gm8356J3QPD3 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm8356J3QPD3 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm8356J3QPD3 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm8356J3QPD3 Pde1b-205ENSMUST00000227955 3258 ntAPPRIS ALT1 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm8356J3QPD3 P2ry1-202ENSMUST00000193201 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm8356J3QPD3 Cnr2-202ENSMUST00000097843 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm8356J3QPD3 Pigc-205ENSMUST00000193784 4207 ntAPPRIS P1 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm8356J3QPD3 Gm7967-202ENSMUST00000191042 5042 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm8356J3QPD3 Zzef1-207ENSMUST00000172220 11249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm8356J3QPD3 Sirpa-204ENSMUST00000103203 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm8356J3QPD3 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm8356J3QPD3 Pou2f1-206ENSMUST00000111429 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm8356J3QPD3 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm8356J3QPD3 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm8356J3QPD3 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Gm8356J3QPD3 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms