Protein–RNA interactions for Protein: J3QK46

Tmem200c, Transmembrane protein 200C, mousemouse

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Length 637 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem200cJ3QK46 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem200cJ3QK46 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem200cJ3QK46 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem200cJ3QK46 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem200cJ3QK46 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem200cJ3QK46 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem200cJ3QK46 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem200cJ3QK46 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem200cJ3QK46 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem200cJ3QK46 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem200cJ3QK46 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem200cJ3QK46 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem200cJ3QK46 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem200cJ3QK46 Gm11801-201ENSMUST00000117807 746 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem200cJ3QK46 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem200cJ3QK46 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem200cJ3QK46 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem200cJ3QK46 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem200cJ3QK46 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem200cJ3QK46 Gm23218-201ENSMUST00000158124 276 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem200cJ3QK46 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem200cJ3QK46 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem200cJ3QK46 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem200cJ3QK46 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem200cJ3QK46 1700012D14Rik-204ENSMUST00000210788 547 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem200cJ3QK46 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem200cJ3QK46 AC140375.1-201ENSMUST00000225421 694 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem200cJ3QK46 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem200cJ3QK46 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem200cJ3QK46 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem200cJ3QK46 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem200cJ3QK46 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem200cJ3QK46 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem200cJ3QK46 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem200cJ3QK46 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem200cJ3QK46 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem200cJ3QK46 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem200cJ3QK46 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem200cJ3QK46 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem200cJ3QK46 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem200cJ3QK46 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem200cJ3QK46 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem200cJ3QK46 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem200cJ3QK46 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem200cJ3QK46 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem200cJ3QK46 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem200cJ3QK46 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tmem200cJ3QK46 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem200cJ3QK46 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem200cJ3QK46 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem200cJ3QK46 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem200cJ3QK46 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem200cJ3QK46 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem200cJ3QK46 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem200cJ3QK46 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem200cJ3QK46 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem200cJ3QK46 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem200cJ3QK46 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem200cJ3QK46 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem200cJ3QK46 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem200cJ3QK46 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Tmem200cJ3QK46 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem200cJ3QK46 Flicr-201ENSMUST00000144719 3455 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Tmem200cJ3QK46 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem200cJ3QK46 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Tmem200cJ3QK46 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem200cJ3QK46 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Tmem200cJ3QK46 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem200cJ3QK46 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem200cJ3QK46 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem200cJ3QK46 BC016548-202ENSMUST00000153797 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem200cJ3QK46 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Tmem200cJ3QK46 Pdcd5-ps-201ENSMUST00000191699 381 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem200cJ3QK46 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem200cJ3QK46 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem200cJ3QK46 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem200cJ3QK46 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem200cJ3QK46 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem200cJ3QK46 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem200cJ3QK46 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem200cJ3QK46 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem200cJ3QK46 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem200cJ3QK46 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem200cJ3QK46 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem200cJ3QK46 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem200cJ3QK46 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem200cJ3QK46 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem200cJ3QK46 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem200cJ3QK46 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem200cJ3QK46 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem200cJ3QK46 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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