Protein–RNA interactions for Protein: F8VQM8

Xntrpc, Xndc1-transient receptor potential cation channel, subfamily C, member 2 readthrough, mousemouse

Predictions only

Length 1,264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XntrpcF8VQM8 Gm17135-201ENSMUST00000167009 564 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Gm20536-201ENSMUST00000172588 406 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Gm21844-201ENSMUST00000178699 663 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Gm9884-201ENSMUST00000194343 1222 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 9530034A14Rik-201ENSMUST00000197919 1083 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Gm3726-201ENSMUST00000203110 785 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Gm45338-204ENSMUST00000210658 1105 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 AC129308.3-201ENSMUST00000225652 524 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Mnd1-201ENSMUST00000047368 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Krtap4-13-201ENSMUST00000050106 815 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 1700001K19Rik-201ENSMUST00000070659 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Arhgap19-204ENSMUST00000177495 1652 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Tarm1-203ENSMUST00000203821 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Airn-205ENSMUST00000161890 1375 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
XntrpcF8VQM8 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
XntrpcF8VQM8 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
XntrpcF8VQM8 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC11.9□□□□□ -0.51
XntrpcF8VQM8 Zfp85os-202ENSMUST00000143812 1784 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
XntrpcF8VQM8 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
XntrpcF8VQM8 Ntm-201ENSMUST00000075069 3022 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
XntrpcF8VQM8 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
XntrpcF8VQM8 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
XntrpcF8VQM8 Zfp410-215ENSMUST00000222832 1859 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
XntrpcF8VQM8 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
XntrpcF8VQM8 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
XntrpcF8VQM8 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
XntrpcF8VQM8 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
XntrpcF8VQM8 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
XntrpcF8VQM8 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
XntrpcF8VQM8 Rhox3d-ps-201ENSMUST00000119181 825 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
XntrpcF8VQM8 Gm13703-201ENSMUST00000150705 449 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
XntrpcF8VQM8 Pfdn6-202ENSMUST00000173363 871 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
XntrpcF8VQM8 Gm5294-201ENSMUST00000179205 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
XntrpcF8VQM8 Gm17597-201ENSMUST00000181220 1115 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
XntrpcF8VQM8 AU020206-201ENSMUST00000181224 656 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
XntrpcF8VQM8 Mrip-ps-201ENSMUST00000184613 940 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
XntrpcF8VQM8 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
XntrpcF8VQM8 Diablo-210ENSMUST00000200247 748 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
XntrpcF8VQM8 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
XntrpcF8VQM8 Gm45570-201ENSMUST00000211137 495 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
XntrpcF8VQM8 Hsd17b3-201ENSMUST00000039832 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
XntrpcF8VQM8 Ass1-201ENSMUST00000102840 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
XntrpcF8VQM8 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
XntrpcF8VQM8 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
XntrpcF8VQM8 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
XntrpcF8VQM8 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
XntrpcF8VQM8 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
XntrpcF8VQM8 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
XntrpcF8VQM8 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
XntrpcF8VQM8 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
XntrpcF8VQM8 Gm43152-201ENSMUST00000202495 1638 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
XntrpcF8VQM8 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
XntrpcF8VQM8 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
XntrpcF8VQM8 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
XntrpcF8VQM8 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
XntrpcF8VQM8 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
XntrpcF8VQM8 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
XntrpcF8VQM8 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
XntrpcF8VQM8 Serpinb9c-202ENSMUST00000110284 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
XntrpcF8VQM8 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
XntrpcF8VQM8 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
XntrpcF8VQM8 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
XntrpcF8VQM8 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
XntrpcF8VQM8 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
XntrpcF8VQM8 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
XntrpcF8VQM8 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
XntrpcF8VQM8 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
XntrpcF8VQM8 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
XntrpcF8VQM8 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
XntrpcF8VQM8 Trav13d-1-201ENSMUST00000103588 396 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
XntrpcF8VQM8 Gm13284-201ENSMUST00000121020 547 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
XntrpcF8VQM8 Mfsd11-212ENSMUST00000153084 1194 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
XntrpcF8VQM8 Gm12406-201ENSMUST00000155382 697 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
XntrpcF8VQM8 Gm25343-201ENSMUST00000157460 107 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
XntrpcF8VQM8 Dydc1-202ENSMUST00000161837 829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
XntrpcF8VQM8 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
XntrpcF8VQM8 Gm9369-201ENSMUST00000196009 733 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
XntrpcF8VQM8 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
XntrpcF8VQM8 AC122024.3-201ENSMUST00000217719 294 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
XntrpcF8VQM8 Gm9508-201ENSMUST00000220084 693 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
XntrpcF8VQM8 CT030653.1-201ENSMUST00000224382 1279 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
XntrpcF8VQM8 AC154305.2-201ENSMUST00000225813 901 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
XntrpcF8VQM8 AC122035.1-201ENSMUST00000227576 1016 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
XntrpcF8VQM8 Crygb-201ENSMUST00000027090 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
XntrpcF8VQM8 Gm10135-201ENSMUST00000043711 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
XntrpcF8VQM8 Mok-203ENSMUST00000084974 1132 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
XntrpcF8VQM8 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
XntrpcF8VQM8 Snrpg-201ENSMUST00000089558 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms