Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Gm44826-201ENSMUST00000207648 2332 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Capn5-201ENSMUST00000040971 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Cacna1c-219ENSMUST00000189389 6603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Zfp114-203ENSMUST00000206547 3154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Gm42427-201ENSMUST00000200473 5292 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2-M1F7CXU4 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms