Protein–RNA interactions for Protein: F6U8B9

Gm17555, Predicted gene, 17555, mousemouse

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Length 371 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17555F6U8B9 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm17555F6U8B9 Camk2g-201ENSMUST00000071816 3703 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm17555F6U8B9 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm17555F6U8B9 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm17555F6U8B9 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm17555F6U8B9 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm17555F6U8B9 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm17555F6U8B9 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm17555F6U8B9 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm17555F6U8B9 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm17555F6U8B9 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm17555F6U8B9 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm17555F6U8B9 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm17555F6U8B9 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm17555F6U8B9 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm17555F6U8B9 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm17555F6U8B9 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm17555F6U8B9 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm17555F6U8B9 Myo18a-223ENSMUST00000169105 6475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm17555F6U8B9 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm17555F6U8B9 Gm20052-201ENSMUST00000200831 1525 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm17555F6U8B9 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm17555F6U8B9 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm17555F6U8B9 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm17555F6U8B9 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm17555F6U8B9 Usp2-203ENSMUST00000114830 2122 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm17555F6U8B9 Gnl2-201ENSMUST00000030684 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm17555F6U8B9 Kbtbd12-206ENSMUST00000184878 3351 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm17555F6U8B9 Msh3-201ENSMUST00000022220 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm17555F6U8B9 Rad51c-202ENSMUST00000067692 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm17555F6U8B9 Med17-201ENSMUST00000034411 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm17555F6U8B9 Celf1-205ENSMUST00000111449 4441 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm17555F6U8B9 Sptb-202ENSMUST00000166101 8084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm17555F6U8B9 Gmps-201ENSMUST00000029405 8105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Gm17555F6U8B9 Card14-202ENSMUST00000106250 4206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17555F6U8B9 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17555F6U8B9 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17555F6U8B9 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17555F6U8B9 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17555F6U8B9 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17555F6U8B9 Atxn1l-201ENSMUST00000093162 7526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17555F6U8B9 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17555F6U8B9 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17555F6U8B9 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17555F6U8B9 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17555F6U8B9 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17555F6U8B9 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17555F6U8B9 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17555F6U8B9 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17555F6U8B9 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17555F6U8B9 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17555F6U8B9 Arsb-201ENSMUST00000091403 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17555F6U8B9 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17555F6U8B9 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17555F6U8B9 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17555F6U8B9 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17555F6U8B9 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17555F6U8B9 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17555F6U8B9 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17555F6U8B9 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17555F6U8B9 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17555F6U8B9 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17555F6U8B9 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17555F6U8B9 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17555F6U8B9 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17555F6U8B9 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17555F6U8B9 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17555F6U8B9 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17555F6U8B9 Mkx-201ENSMUST00000079788 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17555F6U8B9 Recql-202ENSMUST00000100832 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17555F6U8B9 Inpp4a-208ENSMUST00000137266 2934 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17555F6U8B9 Slc6a18-201ENSMUST00000022105 2839 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17555F6U8B9 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17555F6U8B9 Mx2-202ENSMUST00000188251 2421 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17555F6U8B9 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17555F6U8B9 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17555F6U8B9 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17555F6U8B9 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17555F6U8B9 Ddr1-202ENSMUST00000097333 3593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17555F6U8B9 Prr30-202ENSMUST00000187304 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17555F6U8B9 Cep112-213ENSMUST00000150863 3453 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17555F6U8B9 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Gm17555F6U8B9 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17555F6U8B9 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17555F6U8B9 Zfp280b-201ENSMUST00000061617 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17555F6U8B9 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17555F6U8B9 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17555F6U8B9 Plxna3-201ENSMUST00000004326 6943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17555F6U8B9 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17555F6U8B9 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17555F6U8B9 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17555F6U8B9 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17555F6U8B9 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17555F6U8B9 Svil-211ENSMUST00000143254 6594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17555F6U8B9 Psd-202ENSMUST00000096029 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17555F6U8B9 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17555F6U8B9 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17555F6U8B9 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17555F6U8B9 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17555F6U8B9 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
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