Protein–RNA interactions for Protein: E9QAP7

Taf4, TATA-box-binding protein-associated factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4E9QAP7 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Taf4E9QAP7 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Taf4E9QAP7 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Taf4E9QAP7 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Taf4E9QAP7 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Taf4E9QAP7 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Taf4E9QAP7 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Taf4E9QAP7 Tro-203ENSMUST00000112709 6610 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Taf4E9QAP7 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Taf4E9QAP7 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Taf4E9QAP7 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Taf4E9QAP7 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Taf4E9QAP7 Cbfa2t2-204ENSMUST00000109725 6080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Taf4E9QAP7 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Taf4E9QAP7 Myh13-201ENSMUST00000081911 5817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Taf4E9QAP7 Baiap3-206ENSMUST00000182825 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Taf4E9QAP7 Gria4-202ENSMUST00000063508 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Taf4E9QAP7 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Taf4E9QAP7 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Taf4E9QAP7 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Taf4E9QAP7 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Taf4E9QAP7 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Taf4E9QAP7 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Taf4E9QAP7 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Taf4E9QAP7 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Taf4E9QAP7 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Taf4E9QAP7 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Taf4E9QAP7 Astn1-205ENSMUST00000193042 7248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Taf4E9QAP7 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Taf4E9QAP7 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Taf4E9QAP7 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Taf4E9QAP7 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Taf4E9QAP7 1700012D14Rik-204ENSMUST00000210788 547 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Taf4E9QAP7 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Taf4E9QAP7 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Taf4E9QAP7 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Taf4E9QAP7 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Taf4E9QAP7 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Taf4E9QAP7 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Taf4E9QAP7 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Taf4E9QAP7 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Taf4E9QAP7 Pak7-201ENSMUST00000035264 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Taf4E9QAP7 Sipa1l3-215ENSMUST00000183096 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Taf4E9QAP7 Sipa1l3-201ENSMUST00000085809 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Taf4E9QAP7 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Taf4E9QAP7 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Taf4E9QAP7 Svil-211ENSMUST00000143254 6594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Taf4E9QAP7 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Taf4E9QAP7 Tyro3-202ENSMUST00000110783 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Taf4E9QAP7 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Taf4E9QAP7 Dmbx1-203ENSMUST00000124071 4017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Taf4E9QAP7 Mettl14-204ENSMUST00000174323 4202 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Taf4E9QAP7 Imp4-201ENSMUST00000027303 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Taf4E9QAP7 Dysf-202ENSMUST00000089595 6613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Taf4E9QAP7 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Taf4E9QAP7 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Taf4E9QAP7 Smg6-201ENSMUST00000045281 5848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Taf4E9QAP7 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Taf4E9QAP7 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Taf4E9QAP7 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Taf4E9QAP7 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Taf4E9QAP7 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Taf4E9QAP7 Gm22877-201ENSMUST00000175451 105 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Taf4E9QAP7 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Taf4E9QAP7 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Taf4E9QAP7 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Taf4E9QAP7 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Taf4E9QAP7 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Taf4E9QAP7 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Taf4E9QAP7 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Taf4E9QAP7 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Taf4E9QAP7 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Taf4E9QAP7 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Taf4E9QAP7 Vwa5b2-202ENSMUST00000096197 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Taf4E9QAP7 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Taf4E9QAP7 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Taf4E9QAP7 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Taf4E9QAP7 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Taf4E9QAP7 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Taf4E9QAP7 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Taf4E9QAP7 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Taf4E9QAP7 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Taf4E9QAP7 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.3 ms