Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5S8

Fam46a, Family with sequence similarity 46, member A, mousemouse

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam46aD3Z5S8 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Fam46aD3Z5S8 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Fam46aD3Z5S8 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Fam46aD3Z5S8 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Fam46aD3Z5S8 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Fam46aD3Z5S8 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Fam46aD3Z5S8 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Fam46aD3Z5S8 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Fam46aD3Z5S8 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Fam46aD3Z5S8 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Fam46aD3Z5S8 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Fam46aD3Z5S8 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Fam46aD3Z5S8 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Fam46aD3Z5S8 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Fam46aD3Z5S8 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Fam46aD3Z5S8 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Fam46aD3Z5S8 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Fam46aD3Z5S8 Mrpl24-204ENSMUST00000121920 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Fam46aD3Z5S8 Gm15409-201ENSMUST00000135240 520 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Fam46aD3Z5S8 Apobr-203ENSMUST00000137646 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Fam46aD3Z5S8 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Fam46aD3Z5S8 Fcgr2b-203ENSMUST00000159688 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Fam46aD3Z5S8 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Fam46aD3Z5S8 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Fam46aD3Z5S8 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Fam46aD3Z5S8 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Fam46aD3Z5S8 Gm37709-201ENSMUST00000195074 600 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Fam46aD3Z5S8 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Fam46aD3Z5S8 Zmiz1os1-202ENSMUST00000225188 1223 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Fam46aD3Z5S8 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Fam46aD3Z5S8 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Fam46aD3Z5S8 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Fam46aD3Z5S8 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Fam46aD3Z5S8 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Fam46aD3Z5S8 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Fam46aD3Z5S8 Gm29151-201ENSMUST00000196669 2513 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Fam46aD3Z5S8 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Fam46aD3Z5S8 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Fam46aD3Z5S8 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Fam46aD3Z5S8 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Fam46aD3Z5S8 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Fam46aD3Z5S8 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Fam46aD3Z5S8 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Fam46aD3Z5S8 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Fam46aD3Z5S8 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Fam46aD3Z5S8 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Fam46aD3Z5S8 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Fam46aD3Z5S8 Milr1-202ENSMUST00000106794 1514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Fam46aD3Z5S8 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Fam46aD3Z5S8 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Fam46aD3Z5S8 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Fam46aD3Z5S8 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Fam46aD3Z5S8 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Fam46aD3Z5S8 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Fam46aD3Z5S8 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Fam46aD3Z5S8 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Fam46aD3Z5S8 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Fam46aD3Z5S8 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Fam46aD3Z5S8 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Fam46aD3Z5S8 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Fam46aD3Z5S8 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Fam46aD3Z5S8 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Fam46aD3Z5S8 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Fam46aD3Z5S8 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Fam46aD3Z5S8 Gm18499-201ENSMUST00000220808 1021 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Fam46aD3Z5S8 AC173345.3-201ENSMUST00000221245 1093 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Fam46aD3Z5S8 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Fam46aD3Z5S8 AC154361.2-201ENSMUST00000224747 943 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Fam46aD3Z5S8 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Fam46aD3Z5S8 Gm5805-201ENSMUST00000072779 456 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Fam46aD3Z5S8 mt-Nd3-201ENSMUST00000082411 348 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Fam46aD3Z5S8 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Fam46aD3Z5S8 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Fam46aD3Z5S8 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Fam46aD3Z5S8 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Fam46aD3Z5S8 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Fam46aD3Z5S8 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Fam46aD3Z5S8 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Fam46aD3Z5S8 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Fam46aD3Z5S8 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Fam46aD3Z5S8 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Fam46aD3Z5S8 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Fam46aD3Z5S8 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Fam46aD3Z5S8 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Fam46aD3Z5S8 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Fam46aD3Z5S8 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Fam46aD3Z5S8 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms