Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Myo5a-201ENSMUST00000123128 11702 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nhsl1-202ENSMUST00000100054 6795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm42047-202ENSMUST00000212899 4988 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Jmjd4-201ENSMUST00000045279 4315 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mllt10-201ENSMUST00000028076 4917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28774-201ENSMUST00000187087 1498 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Spen-202ENSMUST00000105786 12299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp827-203ENSMUST00000119254 4549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Helz-202ENSMUST00000100305 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Peg10-203ENSMUST00000176551 6567 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nampt-201ENSMUST00000020886 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Col19a1-202ENSMUST00000115244 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms