Protein–RNA interactions for Protein: B9EKI3

Tmf1, TATA element modulatory factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmf1B9EKI3 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmf1B9EKI3 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmf1B9EKI3 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmf1B9EKI3 Ralyl-202ENSMUST00000108373 267 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmf1B9EKI3 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmf1B9EKI3 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmf1B9EKI3 1110036E04Rik-201ENSMUST00000181151 777 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmf1B9EKI3 Gm4753-201ENSMUST00000188327 1255 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmf1B9EKI3 C630004L07Rik-201ENSMUST00000193236 1275 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmf1B9EKI3 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmf1B9EKI3 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmf1B9EKI3 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmf1B9EKI3 Cinp-204ENSMUST00000221102 536 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmf1B9EKI3 AC153152.3-201ENSMUST00000222188 1135 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmf1B9EKI3 Crygb-201ENSMUST00000027090 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmf1B9EKI3 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmf1B9EKI3 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmf1B9EKI3 Zfp286-202ENSMUST00000108705 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmf1B9EKI3 Kif22-ps-201ENSMUST00000119302 1984 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmf1B9EKI3 1110051M20Rik-202ENSMUST00000094835 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmf1B9EKI3 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmf1B9EKI3 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmf1B9EKI3 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmf1B9EKI3 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmf1B9EKI3 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmf1B9EKI3 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmf1B9EKI3 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmf1B9EKI3 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmf1B9EKI3 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmf1B9EKI3 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmf1B9EKI3 Vgll4-201ENSMUST00000032459 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmf1B9EKI3 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmf1B9EKI3 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmf1B9EKI3 Cat-202ENSMUST00000111168 779 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmf1B9EKI3 Spata3-207ENSMUST00000135440 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmf1B9EKI3 Snhg17-205ENSMUST00000151331 529 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmf1B9EKI3 Gm25343-201ENSMUST00000157460 107 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmf1B9EKI3 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmf1B9EKI3 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmf1B9EKI3 Mir99ahg-209ENSMUST00000182820 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmf1B9EKI3 Gm29292-201ENSMUST00000186169 766 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmf1B9EKI3 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmf1B9EKI3 Gm9369-201ENSMUST00000196009 733 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmf1B9EKI3 AC153891.1-201ENSMUST00000213761 742 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmf1B9EKI3 Id2-203ENSMUST00000222667 958 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmf1B9EKI3 CT009536.2-201ENSMUST00000225370 665 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmf1B9EKI3 Spata3-201ENSMUST00000052854 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmf1B9EKI3 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmf1B9EKI3 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmf1B9EKI3 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmf1B9EKI3 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmf1B9EKI3 Ccdc60-202ENSMUST00000086483 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmf1B9EKI3 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmf1B9EKI3 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmf1B9EKI3 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmf1B9EKI3 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmf1B9EKI3 Acsm2-202ENSMUST00000098084 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmf1B9EKI3 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmf1B9EKI3 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmf1B9EKI3 Rwdd3-204ENSMUST00000106466 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmf1B9EKI3 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmf1B9EKI3 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmf1B9EKI3 Igkv3-10-201ENSMUST00000103397 356 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmf1B9EKI3 Camk2a-205ENSMUST00000115297 499 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmf1B9EKI3 Hint1-202ENSMUST00000117710 580 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmf1B9EKI3 Gm25545-201ENSMUST00000122673 323 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmf1B9EKI3 Gm29410-201ENSMUST00000188383 694 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmf1B9EKI3 Gm29083-201ENSMUST00000189205 733 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmf1B9EKI3 Cox6b1-204ENSMUST00000208838 354 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmf1B9EKI3 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmf1B9EKI3 AC126799.1-201ENSMUST00000221976 246 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmf1B9EKI3 Fam212a-201ENSMUST00000048568 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmf1B9EKI3 Uba52-201ENSMUST00000081940 541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmf1B9EKI3 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmf1B9EKI3 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmf1B9EKI3 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmf1B9EKI3 Gm29684-201ENSMUST00000220248 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmf1B9EKI3 Acnat2-202ENSMUST00000107698 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmf1B9EKI3 Gm7278-201ENSMUST00000119836 1401 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmf1B9EKI3 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmf1B9EKI3 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmf1B9EKI3 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmf1B9EKI3 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmf1B9EKI3 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmf1B9EKI3 Npl-201ENSMUST00000041874 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmf1B9EKI3 Pde4b-206ENSMUST00000106907 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmf1B9EKI3 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmf1B9EKI3 Sept9-205ENSMUST00000106354 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmf1B9EKI3 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmf1B9EKI3 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmf1B9EKI3 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmf1B9EKI3 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmf1B9EKI3 Gm1110-201ENSMUST00000115261 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmf1B9EKI3 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmf1B9EKI3 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmf1B9EKI3 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmf1B9EKI3 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmf1B9EKI3 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmf1B9EKI3 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmf1B9EKI3 Gm25063-201ENSMUST00000104666 94 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms