Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Gm12418-201ENSMUST00000118116 942 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 1700057H21Rik-202ENSMUST00000154530 506 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Gm16538-201ENSMUST00000162407 442 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Gm7255-201ENSMUST00000187371 908 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Itgax-203ENSMUST00000205460 1215 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Calca-207ENSMUST00000206853 720 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Gm44605-201ENSMUST00000206892 949 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Nps-202ENSMUST00000210697 1082 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Ebi3-201ENSMUST00000003274 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Ctrl-201ENSMUST00000034368 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Gm9758-201ENSMUST00000035980 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Olfr63-201ENSMUST00000067840 955 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 4930572O03Rik-201ENSMUST00000092696 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Ap5s1-201ENSMUST00000089506 1432 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 AC155245.1-201ENSMUST00000222266 1804 ntBASIC10□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Slc25a25-202ENSMUST00000052119 3529 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Eef1a1-201ENSMUST00000042235 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Ccdc78-201ENSMUST00000095500 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Gm14497-201ENSMUST00000119537 580 ntBASIC10□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Ubl5-211ENSMUST00000162303 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Gm9372-201ENSMUST00000168454 430 ntBASIC10□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Gm27211-201ENSMUST00000183507 631 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Gm32591-203ENSMUST00000204725 696 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Gm45094-201ENSMUST00000207013 617 ntBASIC10□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Cox6b1-204ENSMUST00000208838 354 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Olfr335-ps-201ENSMUST00000223545 939 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Nme6-201ENSMUST00000035053 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Uqcc3-201ENSMUST00000096253 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Stk31-201ENSMUST00000024171 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC10□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Gm2721-201ENSMUST00000222380 1571 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC10□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Gm42970-201ENSMUST00000196407 1352 ntBASIC10□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Akap3-202ENSMUST00000202574 2879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Zbtb43-203ENSMUST00000113156 1828 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Gm23769-201ENSMUST00000104441 121 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Smim8-204ENSMUST00000108133 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Gm14165-201ENSMUST00000121456 952 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 A230006K03Rik-202ENSMUST00000154958 901 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 7420461P10Rik-201ENSMUST00000169439 781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Gm44698-201ENSMUST00000207382 384 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 AC122024.3-201ENSMUST00000217719 294 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Arhgef33-207ENSMUST00000224966 490 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Mrpl33-201ENSMUST00000031024 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Acnat2-202ENSMUST00000107698 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Prss23os-202ENSMUST00000179361 1362 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Txndc9-208ENSMUST00000195247 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PtprbB2RU80 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms