Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 Chdh-202ENSMUST00000118917 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 Ptp4a3-203ENSMUST00000165541 3539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 Eps8l1-204ENSMUST00000163893 3868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 Tmc5-203ENSMUST00000121715 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 Cd55-201ENSMUST00000027650 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 Gm45234-201ENSMUST00000129411 4359 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 Nfkbiz-202ENSMUST00000096026 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 Olfr742-203ENSMUST00000217437 2244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 Slc17a5-201ENSMUST00000052441 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 Zfp354a-204ENSMUST00000109122 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 Mettl14-204ENSMUST00000174323 4202 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 Lingo1-201ENSMUST00000053568 3295 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 1700030K09Rik-202ENSMUST00000121902 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 4833418N02Rik-201ENSMUST00000137539 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 Lima1-201ENSMUST00000073691 4215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 Sod3-201ENSMUST00000101208 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 Cbfa2t2-204ENSMUST00000109725 6080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Prrt4B2RU40 Pla2g4c-201ENSMUST00000043612 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Olfr1415-202ENSMUST00000204009 2815 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Prrt4B2RU40 Gm37031-201ENSMUST00000195487 2530 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
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