Protein–RNA interactions for Protein: B2RQG2

Phf3, PHD finger protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,025 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf3B2RQG2 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Phf3B2RQG2 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Phf3B2RQG2 Slc37a4-202ENSMUST00000213268 1353 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Phf3B2RQG2 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Phf3B2RQG2 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Phf3B2RQG2 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Phf3B2RQG2 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Phf3B2RQG2 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Phf3B2RQG2 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Phf3B2RQG2 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Phf3B2RQG2 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Phf3B2RQG2 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Phf3B2RQG2 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Phf3B2RQG2 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Phf3B2RQG2 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Phf3B2RQG2 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Phf3B2RQG2 Cep350-204ENSMUST00000138762 13307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Phf3B2RQG2 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Phf3B2RQG2 Trav13d-1-201ENSMUST00000103588 396 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Phf3B2RQG2 Gm15620-201ENSMUST00000122949 270 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Phf3B2RQG2 Gm25554-201ENSMUST00000158075 113 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Phf3B2RQG2 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Phf3B2RQG2 Gm28833-201ENSMUST00000189671 559 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Phf3B2RQG2 Gm5700-201ENSMUST00000191483 989 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Phf3B2RQG2 Fkbp6-204ENSMUST00000201791 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Phf3B2RQG2 Gm42655-201ENSMUST00000202782 1134 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Phf3B2RQG2 1700086D15Rik-201ENSMUST00000020855 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Phf3B2RQG2 AC153887.1-201ENSMUST00000219154 1253 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Phf3B2RQG2 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Phf3B2RQG2 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Phf3B2RQG2 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Phf3B2RQG2 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Phf3B2RQG2 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Phf3B2RQG2 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Phf3B2RQG2 Gm1110-201ENSMUST00000115261 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Phf3B2RQG2 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Phf3B2RQG2 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Phf3B2RQG2 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Phf3B2RQG2 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Phf3B2RQG2 Gm5641-201ENSMUST00000091130 1488 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Phf3B2RQG2 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Phf3B2RQG2 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Phf3B2RQG2 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Phf3B2RQG2 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Phf3B2RQG2 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Phf3B2RQG2 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Phf3B2RQG2 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Phf3B2RQG2 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Phf3B2RQG2 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Phf3B2RQG2 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Phf3B2RQG2 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Phf3B2RQG2 Csf1-204ENSMUST00000120654 821 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Phf3B2RQG2 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Phf3B2RQG2 Nudt7-204ENSMUST00000134593 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Phf3B2RQG2 AU020206-201ENSMUST00000181224 656 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Phf3B2RQG2 B230110C06Rik-201ENSMUST00000181388 1274 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Phf3B2RQG2 Gm9884-201ENSMUST00000194343 1222 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Phf3B2RQG2 Gm43671-201ENSMUST00000200422 433 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Phf3B2RQG2 Gm29763-201ENSMUST00000205306 616 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Phf3B2RQG2 Gm45613-201ENSMUST00000210718 443 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Phf3B2RQG2 Gm18499-201ENSMUST00000220808 1021 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Phf3B2RQG2 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Phf3B2RQG2 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Phf3B2RQG2 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Phf3B2RQG2 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Phf3B2RQG2 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Phf3B2RQG2 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Phf3B2RQG2 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Phf3B2RQG2 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Phf3B2RQG2 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Phf3B2RQG2 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Phf3B2RQG2 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Phf3B2RQG2 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Phf3B2RQG2 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Phf3B2RQG2 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Phf3B2RQG2 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Phf3B2RQG2 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Phf3B2RQG2 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Phf3B2RQG2 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Phf3B2RQG2 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Phf3B2RQG2 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Phf3B2RQG2 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Phf3B2RQG2 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Phf3B2RQG2 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Phf3B2RQG2 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Phf3B2RQG2 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Phf3B2RQG2 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Phf3B2RQG2 Cdk5rap1-202ENSMUST00000109730 1227 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Phf3B2RQG2 Gm12948-201ENSMUST00000119406 682 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Phf3B2RQG2 Gm14993-201ENSMUST00000121180 164 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Phf3B2RQG2 Spaca9-202ENSMUST00000124840 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Phf3B2RQG2 Zfp961-203ENSMUST00000132848 781 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Phf3B2RQG2 Gm13802-201ENSMUST00000150159 663 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Phf3B2RQG2 Gas5-224ENSMUST00000162558 502 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Phf3B2RQG2 Gm26976-201ENSMUST00000182929 908 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Phf3B2RQG2 Gm37229-201ENSMUST00000191643 732 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Phf3B2RQG2 Mrpl30-207ENSMUST00000195373 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Phf3B2RQG2 Gm5870-201ENSMUST00000196461 282 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Phf3B2RQG2 Arhgef33-207ENSMUST00000224966 490 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Phf3B2RQG2 Cxcl1-201ENSMUST00000031327 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.5 ms