Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB9

Lcn6, LCN6 isoform alpha, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn6A2AJB9 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Lcn6A2AJB9 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Lcn6A2AJB9 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Lcn6A2AJB9 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Lcn6A2AJB9 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Lcn6A2AJB9 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Lcn6A2AJB9 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Lcn6A2AJB9 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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Lcn6A2AJB9 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
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Lcn6A2AJB9 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Lcn6A2AJB9 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Lcn6A2AJB9 Gm24992-201ENSMUST00000157412 130 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
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Lcn6A2AJB9 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Lcn6A2AJB9 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Lcn6A2AJB9 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Lcn6A2AJB9 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Lcn6A2AJB9 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Lcn6A2AJB9 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Lcn6A2AJB9 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Lcn6A2AJB9 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Lcn6A2AJB9 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Lcn6A2AJB9 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Lcn6A2AJB9 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Lcn6A2AJB9 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Lcn6A2AJB9 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Lcn6A2AJB9 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Lcn6A2AJB9 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Lcn6A2AJB9 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Lcn6A2AJB9 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Lcn6A2AJB9 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Lcn6A2AJB9 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Lcn6A2AJB9 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Lcn6A2AJB9 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Lcn6A2AJB9 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Lcn6A2AJB9 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Lcn6A2AJB9 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lcn6A2AJB9 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lcn6A2AJB9 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lcn6A2AJB9 Gpr146-203ENSMUST00000100514 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lcn6A2AJB9 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lcn6A2AJB9 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lcn6A2AJB9 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
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Lcn6A2AJB9 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lcn6A2AJB9 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
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Lcn6A2AJB9 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lcn6A2AJB9 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lcn6A2AJB9 Xlr4c-204ENSMUST00000114531 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
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Lcn6A2AJB9 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lcn6A2AJB9 Gm36176-201ENSMUST00000218749 501 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
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Lcn6A2AJB9 Gm6509-201ENSMUST00000098286 1218 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lcn6A2AJB9 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lcn6A2AJB9 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lcn6A2AJB9 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lcn6A2AJB9 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lcn6A2AJB9 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lcn6A2AJB9 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lcn6A2AJB9 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lcn6A2AJB9 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lcn6A2AJB9 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lcn6A2AJB9 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lcn6A2AJB9 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lcn6A2AJB9 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lcn6A2AJB9 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lcn6A2AJB9 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Lcn6A2AJB9 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lcn6A2AJB9 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lcn6A2AJB9 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lcn6A2AJB9 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lcn6A2AJB9 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lcn6A2AJB9 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Lcn6A2AJB9 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
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