Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L5

Ptprf, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

Predictions only

Length 1,898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprfA2A8L5 Hddc2-201ENSMUST00000000304 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 Iqcf1-201ENSMUST00000085114 613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 4930558J22Rik-201ENSMUST00000139822 1480 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 Impdh2-ps-201ENSMUST00000120826 1545 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 Zw10-201ENSMUST00000034803 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
PtprfA2A8L5 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PtprfA2A8L5 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PtprfA2A8L5 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PtprfA2A8L5 Tubb2b-201ENSMUST00000075774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PtprfA2A8L5 Sh3d21-201ENSMUST00000094760 1859 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PtprfA2A8L5 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PtprfA2A8L5 Fbxo15-201ENSMUST00000037718 1437 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PtprfA2A8L5 Oprm1-222ENSMUST00000135502 1363 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PtprfA2A8L5 S100a3-201ENSMUST00000001047 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PtprfA2A8L5 Lemd1-201ENSMUST00000112357 964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PtprfA2A8L5 Gm12406-201ENSMUST00000155382 697 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
PtprfA2A8L5 Gm26272-201ENSMUST00000179241 132 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
PtprfA2A8L5 Gm26555-201ENSMUST00000180452 1037 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PtprfA2A8L5 Gm28096-201ENSMUST00000191391 824 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
PtprfA2A8L5 Gm42430-201ENSMUST00000197209 616 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
PtprfA2A8L5 Ube2d3-216ENSMUST00000199613 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
PtprfA2A8L5 Gm43275-201ENSMUST00000202053 1020 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
PtprfA2A8L5 Pet100-203ENSMUST00000207389 363 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
PtprfA2A8L5 4933402C05Rik-201ENSMUST00000208189 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PtprfA2A8L5 1700086D15Rik-201ENSMUST00000020855 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
PtprfA2A8L5 AC170997.1-201ENSMUST00000214554 1053 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PtprfA2A8L5 AC133499.1-201ENSMUST00000227778 1097 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
PtprfA2A8L5 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
PtprfA2A8L5 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PtprfA2A8L5 Fanca-202ENSMUST00000118395 3274 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PtprfA2A8L5 Cap1-201ENSMUST00000069533 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PtprfA2A8L5 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PtprfA2A8L5 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PtprfA2A8L5 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
PtprfA2A8L5 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PtprfA2A8L5 Polr3c-201ENSMUST00000029741 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PtprfA2A8L5 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
PtprfA2A8L5 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PtprfA2A8L5 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PtprfA2A8L5 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PtprfA2A8L5 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PtprfA2A8L5 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PtprfA2A8L5 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PtprfA2A8L5 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PtprfA2A8L5 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PtprfA2A8L5 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PtprfA2A8L5 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PtprfA2A8L5 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PtprfA2A8L5 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PtprfA2A8L5 Gm6268-201ENSMUST00000115253 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PtprfA2A8L5 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PtprfA2A8L5 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PtprfA2A8L5 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PtprfA2A8L5 Fastkd5-201ENSMUST00000110262 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PtprfA2A8L5 Ighv1-50-201ENSMUST00000103521 390 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PtprfA2A8L5 Fmr1nb-203ENSMUST00000114647 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PtprfA2A8L5 Snrnp25-202ENSMUST00000121182 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
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PtprfA2A8L5 Pet100-201ENSMUST00000156380 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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PtprfA2A8L5 Mir6941-201ENSMUST00000184711 59 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
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PtprfA2A8L5 Akr1c18-201ENSMUST00000021635 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PtprfA2A8L5 AC170597.1-201ENSMUST00000221956 440 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PtprfA2A8L5 Olfr525-201ENSMUST00000078103 1050 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PtprfA2A8L5 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PtprfA2A8L5 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PtprfA2A8L5 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PtprfA2A8L5 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PtprfA2A8L5 Pmp22-201ENSMUST00000018361 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PtprfA2A8L5 Clu-201ENSMUST00000022616 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PtprfA2A8L5 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PtprfA2A8L5 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PtprfA2A8L5 Ccndbp1-202ENSMUST00000099488 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PtprfA2A8L5 Aldoa-202ENSMUST00000087566 1549 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PtprfA2A8L5 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PtprfA2A8L5 2610028H24Rik-202ENSMUST00000105415 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PtprfA2A8L5 Ccdc136-207ENSMUST00000154619 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
PtprfA2A8L5 Pemt-202ENSMUST00000102692 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PtprfA2A8L5 Rpl7a-201ENSMUST00000102898 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PtprfA2A8L5 Cisd3-203ENSMUST00000107585 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PtprfA2A8L5 Gm12069-201ENSMUST00000145127 806 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PtprfA2A8L5 Gm12906-201ENSMUST00000154610 441 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
PtprfA2A8L5 1700065I16Rik-201ENSMUST00000185277 512 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
PtprfA2A8L5 Gm44953-201ENSMUST00000208745 1286 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
PtprfA2A8L5 Gm45388-201ENSMUST00000209922 1132 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
PtprfA2A8L5 Gm45469-201ENSMUST00000210468 854 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
PtprfA2A8L5 Rp9-204ENSMUST00000216973 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
PtprfA2A8L5 Gm12216-207ENSMUST00000220191 1073 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
PtprfA2A8L5 Nme6-201ENSMUST00000035053 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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