Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1P4

Lgr5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, mousemouse

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Length 907 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr5Q9Z1P4 4930402K13Rik-201ENSMUST00000059967 1781 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Lgr5Q9Z1P4 Cer1-201ENSMUST00000048430 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 Gm5122-202ENSMUST00000216854 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Lgr5Q9Z1P4 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 Prr16-201ENSMUST00000116639 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Lgr5Q9Z1P4 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 Kdelc1-201ENSMUST00000027213 1765 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Lgr5Q9Z1P4 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 Gm13871-202ENSMUST00000107319 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 Gm11757-202ENSMUST00000107321 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 Ptbp1-206ENSMUST00000165704 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 Olfr29-ps1-201ENSMUST00000117959 963 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 B230307C23Rik-202ENSMUST00000122450 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 AC034099.1-202ENSMUST00000133843 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 Fcgr2b-203ENSMUST00000159688 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Lgr5Q9Z1P4 Zfp637-210ENSMUST00000164472 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Lgr5Q9Z1P4 4921524J17Rik-201ENSMUST00000047749 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 Adam20-201ENSMUST00000056331 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 Drg1-201ENSMUST00000020741 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Lgr5Q9Z1P4 Vmn2r-ps54-203ENSMUST00000150856 1142 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Lgr5Q9Z1P4 2610016A17Rik-201ENSMUST00000185211 474 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 Gm28707-201ENSMUST00000186134 558 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 Myo1h-206ENSMUST00000196467 1208 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 Gm42751-201ENSMUST00000198065 559 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 Timm9-210ENSMUST00000221892 734 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 AC113282.5-201ENSMUST00000224330 1679 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Lgr5Q9Z1P4 Eif3d-201ENSMUST00000100484 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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