Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Gm11957-201ENSMUST00000118304 779 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Slfn5os-201ENSMUST00000127074 574 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Gm21964-201ENSMUST00000178785 936 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 4732414G09Rik-202ENSMUST00000180695 408 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Gm18035-201ENSMUST00000211962 589 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Tcf25-210ENSMUST00000212880 827 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 AC122024.3-201ENSMUST00000217719 294 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 AC115304.2-201ENSMUST00000226399 332 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Krtap4-1-201ENSMUST00000081007 1015 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Prss55-201ENSMUST00000089338 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Hist1h2bl-201ENSMUST00000091756 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Lrp2bp-201ENSMUST00000066451 1525 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 D430013B06Rik-201ENSMUST00000192922 1872 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Ppp1r32-201ENSMUST00000038842 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Gm5308-201ENSMUST00000196752 1354 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Ceacam9-201ENSMUST00000001984 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Mir671-201ENSMUST00000102432 98 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Rpl7a-201ENSMUST00000102898 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Styxl1-203ENSMUST00000111162 726 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 1700001C02Rik-202ENSMUST00000114743 729 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Kdm6bos-201ENSMUST00000129924 840 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Gm13783-201ENSMUST00000131634 732 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Gm13026-201ENSMUST00000140113 608 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Gm13008-201ENSMUST00000142289 507 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Gm13802-201ENSMUST00000150159 663 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Gm17606-201ENSMUST00000169818 234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Gm13278-201ENSMUST00000177771 549 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Gm13275-201ENSMUST00000178347 549 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Gm13277-201ENSMUST00000178480 549 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Gm13279-201ENSMUST00000178602 549 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Gm13289-201ENSMUST00000179158 549 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Gm13276-201ENSMUST00000179372 549 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Gm13287-201ENSMUST00000179490 549 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Ube2d3-216ENSMUST00000199613 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Gm6855-201ENSMUST00000206307 790 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Gm40879-201ENSMUST00000220759 612 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Pla2g1b-201ENSMUST00000031495 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Triap1-201ENSMUST00000031508 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Csnk1eQ9JMK2 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Csnk1eQ9JMK2 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Csnk1eQ9JMK2 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Csnk1eQ9JMK2 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Csnk1eQ9JMK2 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Csnk1eQ9JMK2 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Csnk1eQ9JMK2 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Csnk1eQ9JMK2 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
Csnk1eQ9JMK2 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Csnk1eQ9JMK2 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms