Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD3

Scamp5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp5Q9JKD3 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Scamp5Q9JKD3 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Scamp5Q9JKD3 Bora-201ENSMUST00000022656 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Scamp5Q9JKD3 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Scamp5Q9JKD3 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Scamp5Q9JKD3 Gm29684-201ENSMUST00000220248 1982 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Scamp5Q9JKD3 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Scamp5Q9JKD3 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Scamp5Q9JKD3 Gm37651-201ENSMUST00000194679 1494 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Scamp5Q9JKD3 Copz1-201ENSMUST00000100162 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Scamp5Q9JKD3 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Scamp5Q9JKD3 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Scamp5Q9JKD3 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Scamp5Q9JKD3 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Scamp5Q9JKD3 Bmp4-202ENSMUST00000100676 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Scamp5Q9JKD3 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Scamp5Q9JKD3 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Scamp5Q9JKD3 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Scamp5Q9JKD3 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Scamp5Q9JKD3 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Scamp5Q9JKD3 Gm44153-201ENSMUST00000204162 1580 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Scamp5Q9JKD3 Vgll4-201ENSMUST00000032459 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Scamp5Q9JKD3 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Scamp5Q9JKD3 Fam83a-202ENSMUST00000160942 2876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Scamp5Q9JKD3 Clec4a3-201ENSMUST00000088468 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Scamp5Q9JKD3 Gm1110-201ENSMUST00000115261 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Scamp5Q9JKD3 Kif22-ps-201ENSMUST00000119302 1984 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Scamp5Q9JKD3 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Scamp5Q9JKD3 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Scamp5Q9JKD3 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Scamp5Q9JKD3 Gm12791-201ENSMUST00000120788 655 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Scamp5Q9JKD3 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Scamp5Q9JKD3 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Scamp5Q9JKD3 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Scamp5Q9JKD3 AC158605.1-201ENSMUST00000156803 764 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Scamp5Q9JKD3 Gm25343-201ENSMUST00000157460 107 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Scamp5Q9JKD3 4930405O22Rik-201ENSMUST00000164605 954 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Scamp5Q9JKD3 A930036K24Rik-201ENSMUST00000194146 1200 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Scamp5Q9JKD3 Gm9884-201ENSMUST00000194343 1222 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Scamp5Q9JKD3 Gm9369-201ENSMUST00000196009 733 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Scamp5Q9JKD3 Chn2-210ENSMUST00000203091 755 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Scamp5Q9JKD3 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Scamp5Q9JKD3 AC120394.2-201ENSMUST00000213905 702 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Scamp5Q9JKD3 AC129308.3-201ENSMUST00000225652 524 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Scamp5Q9JKD3 Crygb-201ENSMUST00000027090 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Scamp5Q9JKD3 Mnd1-201ENSMUST00000047368 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Scamp5Q9JKD3 Krtap4-13-201ENSMUST00000050106 815 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Scamp5Q9JKD3 Olfr889-201ENSMUST00000072290 945 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Scamp5Q9JKD3 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Scamp5Q9JKD3 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Scamp5Q9JKD3 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Scamp5Q9JKD3 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Scamp5Q9JKD3 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Scamp5Q9JKD3 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Scamp5Q9JKD3 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Scamp5Q9JKD3 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Scamp5Q9JKD3 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Scamp5Q9JKD3 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Scamp5Q9JKD3 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Scamp5Q9JKD3 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Scamp5Q9JKD3 1500002C15Rik-201ENSMUST00000178987 2183 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Scamp5Q9JKD3 Airn-205ENSMUST00000161890 1375 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Scamp5Q9JKD3 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Scamp5Q9JKD3 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Scamp5Q9JKD3 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Scamp5Q9JKD3 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Scamp5Q9JKD3 Tex13c1-201ENSMUST00000105113 2074 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Scamp5Q9JKD3 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Scamp5Q9JKD3 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Scamp5Q9JKD3 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Scamp5Q9JKD3 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Scamp5Q9JKD3 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Scamp5Q9JKD3 Trav13d-1-201ENSMUST00000103588 396 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Scamp5Q9JKD3 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Scamp5Q9JKD3 Gm16323-201ENSMUST00000134920 556 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Scamp5Q9JKD3 Gm20536-201ENSMUST00000172588 406 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Scamp5Q9JKD3 Gm21844-201ENSMUST00000178699 663 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Scamp5Q9JKD3 Gm7929-201ENSMUST00000178711 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Scamp5Q9JKD3 Bhmt-ps1-201ENSMUST00000178743 1224 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Scamp5Q9JKD3 Gm3015-202ENSMUST00000179803 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Scamp5Q9JKD3 Bcl2l12-205ENSMUST00000207755 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Scamp5Q9JKD3 AC154305.2-201ENSMUST00000225813 901 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Scamp5Q9JKD3 Myoz2-201ENSMUST00000029761 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Scamp5Q9JKD3 1700001K19Rik-201ENSMUST00000070659 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Scamp5Q9JKD3 Gm16380-201ENSMUST00000077997 478 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Scamp5Q9JKD3 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Scamp5Q9JKD3 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Scamp5Q9JKD3 Zw10-201ENSMUST00000034803 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Scamp5Q9JKD3 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Scamp5Q9JKD3 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Scamp5Q9JKD3 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Scamp5Q9JKD3 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Scamp5Q9JKD3 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Scamp5Q9JKD3 Pde4b-206ENSMUST00000106907 1374 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Scamp5Q9JKD3 Rtbdn-202ENSMUST00000109740 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Scamp5Q9JKD3 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Scamp5Q9JKD3 Tarm1-203ENSMUST00000203821 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Scamp5Q9JKD3 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Scamp5Q9JKD3 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Scamp5Q9JKD3 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms