Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

Predictions only

Length 869 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Nudt13-203ENSMUST00000223663 1633 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Gm9244-201ENSMUST00000056767 2129 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Gm8197-202ENSMUST00000193422 934 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Gm6509-201ENSMUST00000098286 1218 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Mgl2-205ENSMUST00000165951 1635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Gm17213-201ENSMUST00000165161 1360 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Eid3-201ENSMUST00000211623 1305 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Gm8899-201ENSMUST00000214635 1332 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Rplp2-202ENSMUST00000106003 449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Mrpl20-206ENSMUST00000185148 494 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 1700088E04Rik-211ENSMUST00000190730 691 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Olfr1395-201ENSMUST00000059379 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Vmn1r220-201ENSMUST00000072385 897 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Etfbkmt-209ENSMUST00000179873 1576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Usp29Q9ES63 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63 ms