Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES34

Ube3b, Ubiquitin-protein ligase E3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,070 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3bQ9ES34 Gm21759-201ENSMUST00000178345 1828 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ube3bQ9ES34 Gm43972-201ENSMUST00000181398 1467 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ube3bQ9ES34 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ube3bQ9ES34 Cyp2a22-201ENSMUST00000170227 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ube3bQ9ES34 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ube3bQ9ES34 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ube3bQ9ES34 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ube3bQ9ES34 Fam3a-201ENSMUST00000015427 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ube3bQ9ES34 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ube3bQ9ES34 Pde4b-206ENSMUST00000106907 1374 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ube3bQ9ES34 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ube3bQ9ES34 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ube3bQ9ES34 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ube3bQ9ES34 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ube3bQ9ES34 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ube3bQ9ES34 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ube3bQ9ES34 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ube3bQ9ES34 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ube3bQ9ES34 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ube3bQ9ES34 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ube3bQ9ES34 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ube3bQ9ES34 Gm9673-201ENSMUST00000119287 781 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ube3bQ9ES34 Nop16-202ENSMUST00000148222 790 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ube3bQ9ES34 Gm25343-201ENSMUST00000157460 107 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ube3bQ9ES34 Gm16553-201ENSMUST00000160490 716 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ube3bQ9ES34 Gm9639-201ENSMUST00000172205 678 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ube3bQ9ES34 Gm20536-201ENSMUST00000172588 406 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ube3bQ9ES34 Esp36-201ENSMUST00000172814 1117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ube3bQ9ES34 Esp36-202ENSMUST00000177882 1117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ube3bQ9ES34 1700088E04Rik-211ENSMUST00000190730 691 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ube3bQ9ES34 Gm37028-201ENSMUST00000194276 107 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ube3bQ9ES34 Bcl2l12-205ENSMUST00000207755 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ube3bQ9ES34 4933402C05Rik-201ENSMUST00000208189 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ube3bQ9ES34 Gm45610-201ENSMUST00000209227 784 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ube3bQ9ES34 AC153891.1-201ENSMUST00000213761 742 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ube3bQ9ES34 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ube3bQ9ES34 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ube3bQ9ES34 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ube3bQ9ES34 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ube3bQ9ES34 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ube3bQ9ES34 Ffar2-201ENSMUST00000053156 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ube3bQ9ES34 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ube3bQ9ES34 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ube3bQ9ES34 Dclre1b-203ENSMUST00000106832 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ube3bQ9ES34 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ube3bQ9ES34 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ube3bQ9ES34 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ube3bQ9ES34 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ube3bQ9ES34 Kif22-ps-201ENSMUST00000119302 1984 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ube3bQ9ES34 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ube3bQ9ES34 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ube3bQ9ES34 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ube3bQ9ES34 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ube3bQ9ES34 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ube3bQ9ES34 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ube3bQ9ES34 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ube3bQ9ES34 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ube3bQ9ES34 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ube3bQ9ES34 Tex13c1-201ENSMUST00000105113 2074 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ube3bQ9ES34 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ube3bQ9ES34 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ube3bQ9ES34 Rtn4ip1-201ENSMUST00000054418 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ube3bQ9ES34 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ube3bQ9ES34 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ube3bQ9ES34 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Ube3bQ9ES34 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Ube3bQ9ES34 Rbm3-205ENSMUST00000115619 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Ube3bQ9ES34 1700021J08Rik-201ENSMUST00000138729 575 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ube3bQ9ES34 Gm14266-202ENSMUST00000146542 1067 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ube3bQ9ES34 Dydc1-202ENSMUST00000161837 829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ube3bQ9ES34 A330048O09Rik-201ENSMUST00000180777 672 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ube3bQ9ES34 A930036K24Rik-201ENSMUST00000194146 1200 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
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Ube3bQ9ES34 A930002H02Rik-201ENSMUST00000208672 1178 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ube3bQ9ES34 Cox6b1-204ENSMUST00000208838 354 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ube3bQ9ES34 Gm45338-201ENSMUST00000209198 820 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ube3bQ9ES34 6430710M23Rik-201ENSMUST00000210843 1191 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ube3bQ9ES34 Gm45570-201ENSMUST00000211137 495 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ube3bQ9ES34 AC154252.1-201ENSMUST00000226041 473 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ube3bQ9ES34 Krtap4-13-201ENSMUST00000050106 815 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ube3bQ9ES34 Oosp3-201ENSMUST00000069760 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ube3bQ9ES34 Zim1-203ENSMUST00000203908 1740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ube3bQ9ES34 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ube3bQ9ES34 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ube3bQ9ES34 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ube3bQ9ES34 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ube3bQ9ES34 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ube3bQ9ES34 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ube3bQ9ES34 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ube3bQ9ES34 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ube3bQ9ES34 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ube3bQ9ES34 Acnat2-202ENSMUST00000107698 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ube3bQ9ES34 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ube3bQ9ES34 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ube3bQ9ES34 Bmp4-202ENSMUST00000100676 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ube3bQ9ES34 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ube3bQ9ES34 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
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