Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Matn2-205ENSMUST00000227759 3569 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Spata31d1a-203ENSMUST00000224982 5325 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Zw10-201ENSMUST00000034803 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Tiam2-201ENSMUST00000072156 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Kalrn-202ENSMUST00000089655 6506 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Brpf1-208ENSMUST00000203577 4468 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Rbm27-201ENSMUST00000046972 6134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Slc9a8-202ENSMUST00000073873 4429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Clstn1Q9EPL2 Shank2-205ENSMUST00000146006 7666 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Wipf1-203ENSMUST00000102680 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Clstn1Q9EPL2 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Clstn1Q9EPL2 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Clstn1Q9EPL2 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Clstn1Q9EPL2 Gpr149-201ENSMUST00000058535 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Clstn1Q9EPL2 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Clstn1Q9EPL2 Bcl9-201ENSMUST00000046521 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Clstn1Q9EPL2 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Clstn1Q9EPL2 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Clstn1Q9EPL2 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Clstn1Q9EPL2 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Clstn1Q9EPL2 Defa-ps4-201ENSMUST00000118021 183 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
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Clstn1Q9EPL2 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Clstn1Q9EPL2 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Clstn1Q9EPL2 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Clstn1Q9EPL2 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Clstn1Q9EPL2 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Clstn1Q9EPL2 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Clstn1Q9EPL2 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Clstn1Q9EPL2 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Clstn1Q9EPL2 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Clstn1Q9EPL2 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Clstn1Q9EPL2 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Clstn1Q9EPL2 Arfgef3-201ENSMUST00000019999 5606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Clstn1Q9EPL2 Abcc4-201ENSMUST00000036554 5715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Clstn1Q9EPL2 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Clstn1Q9EPL2 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Clstn1Q9EPL2 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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