Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC33

Hmg20a, High mobility group protein 20A, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20aQ9DC33 Speer4b-201ENSMUST00000053257 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Epc1-201ENSMUST00000028100 3965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Phtf1os-201ENSMUST00000160110 4046 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Zfp710-203ENSMUST00000166250 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Gm44798-201ENSMUST00000208123 2410 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Pif1-201ENSMUST00000047099 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Ywhaz-201ENSMUST00000022894 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Sall2-201ENSMUST00000058326 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Prph2-201ENSMUST00000024773 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Doxl2-203ENSMUST00000184917 2468 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 D030028A08Rik-202ENSMUST00000131501 3542 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Gm44888-201ENSMUST00000209119 2541 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 March10-204ENSMUST00000138977 2979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Kif1b-203ENSMUST00000060537 10233 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 C2cd5-201ENSMUST00000087485 4265 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Slc45a3-202ENSMUST00000177943 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Gm43274-201ENSMUST00000202545 5000 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Atcayos-203ENSMUST00000150782 3057 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Spata16-201ENSMUST00000047005 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Ralgps1-202ENSMUST00000091039 2738 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Zfp873-203ENSMUST00000209622 2284 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Gm37806-201ENSMUST00000194524 6387 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 A830010M20Rik-208ENSMUST00000211896 5256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Sfi1-202ENSMUST00000081318 3969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Ptp4a3-203ENSMUST00000165541 3539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Adgrl3-215ENSMUST00000120673 5178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Celsr3-201ENSMUST00000024238 11547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Slc38a4-202ENSMUST00000166223 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Dpf2-202ENSMUST00000118623 2406 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Gm8271-201ENSMUST00000171053 1469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Tcp10a-203ENSMUST00000129709 1778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Gm5532-201ENSMUST00000097531 1751 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
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Hmg20aQ9DC33 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Atxn1l-202ENSMUST00000212605 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Rbp1-201ENSMUST00000052068 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Abcc3-201ENSMUST00000021231 4999 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Gm43636-201ENSMUST00000201501 2235 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Gm26822-201ENSMUST00000181732 3374 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 C230021G24Rik-201ENSMUST00000181196 3679 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Gpsm1-201ENSMUST00000066889 3432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Efna5-201ENSMUST00000076840 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Tpp2-201ENSMUST00000087933 4649 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Cdh1-203ENSMUST00000167688 3203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Pex2-203ENSMUST00000164828 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Ticam1-201ENSMUST00000058136 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Serpinb8-202ENSMUST00000112706 4581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 9530059O14Rik-201ENSMUST00000181107 3978 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Itgad-201ENSMUST00000033051 3965 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Itga3-202ENSMUST00000107739 4636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Lrrc49-204ENSMUST00000114034 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
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