Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBZ9

Syde1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde1Q9DBZ9 Ostm1-202ENSMUST00000105497 770 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 Tomm5-202ENSMUST00000107808 679 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 Gm12179-201ENSMUST00000118344 1272 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 Gm11578-201ENSMUST00000118530 459 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 Gm14234-201ENSMUST00000119539 845 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 Csf1-204ENSMUST00000120654 821 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 Gm14820-201ENSMUST00000126286 1449 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 Gm17070-201ENSMUST00000170463 784 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 B230110C06Rik-201ENSMUST00000181388 1274 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 Bcl2l12-205ENSMUST00000207755 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 Retnla-201ENSMUST00000023329 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 Gsto1-201ENSMUST00000026050 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 Olfr173-201ENSMUST00000049940 1164 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 Srp19-201ENSMUST00000072576 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 Olfr314-201ENSMUST00000076393 1131 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 Airn-205ENSMUST00000161890 1375 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Syde1Q9DBZ9 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC11.9□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Meikin-201ENSMUST00000094193 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Gm6754-201ENSMUST00000117124 913 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Gm14213-201ENSMUST00000119778 768 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Txnrd2-205ENSMUST00000126778 491 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Gm12705-201ENSMUST00000129460 872 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 AC158605.1-201ENSMUST00000156803 764 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Gm16030-201ENSMUST00000159098 603 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 1700021P04Rik-201ENSMUST00000178667 659 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Gm9507-202ENSMUST00000180157 654 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Nmbr-206ENSMUST00000190114 662 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Fcer2a-206ENSMUST00000208438 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Fcer2a-208ENSMUST00000208603 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Gm45613-201ENSMUST00000210718 443 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Park2-210ENSMUST00000218435 865 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 AC153962.2-201ENSMUST00000219417 550 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 AC123694.1-201ENSMUST00000219525 644 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Fam3a-204ENSMUST00000114141 1243 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Gm15528-201ENSMUST00000117821 864 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Gm12712-201ENSMUST00000120676 801 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Gm12453-201ENSMUST00000121981 331 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Nudt7-204ENSMUST00000134593 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 E030018B13Rik-201ENSMUST00000177638 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Syde1Q9DBZ9 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms