Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU3

Riok3, Serine/threonine-protein kinase RIO3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 519 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riok3Q9DBU3 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Riok3Q9DBU3 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Riok3Q9DBU3 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Riok3Q9DBU3 Gm14280-201ENSMUST00000138080 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Riok3Q9DBU3 Gimd1-201ENSMUST00000163241 1413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Riok3Q9DBU3 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Riok3Q9DBU3 9030607J07Rik-201ENSMUST00000202228 1622 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Riok3Q9DBU3 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Riok3Q9DBU3 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Riok3Q9DBU3 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Riok3Q9DBU3 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Riok3Q9DBU3 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Riok3Q9DBU3 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Riok3Q9DBU3 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Riok3Q9DBU3 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Riok3Q9DBU3 Olfr826-202ENSMUST00000203720 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Riok3Q9DBU3 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Riok3Q9DBU3 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Riok3Q9DBU3 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Riok3Q9DBU3 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Riok3Q9DBU3 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Riok3Q9DBU3 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Riok3Q9DBU3 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Riok3Q9DBU3 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Riok3Q9DBU3 Ppp6c-205ENSMUST00000204701 1495 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Riok3Q9DBU3 AC154207.1-201ENSMUST00000221924 1483 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Riok3Q9DBU3 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Riok3Q9DBU3 Tex52-201ENSMUST00000100926 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Riok3Q9DBU3 Gm9732-201ENSMUST00000111874 492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Riok3Q9DBU3 Foxp2-202ENSMUST00000115469 1293 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Riok3Q9DBU3 Gm9432-201ENSMUST00000117810 759 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Riok3Q9DBU3 C1qtnf7-202ENSMUST00000121872 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Riok3Q9DBU3 Gm14907-201ENSMUST00000121948 854 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Riok3Q9DBU3 Gm22186-201ENSMUST00000157822 122 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Riok3Q9DBU3 4933417A18Rik-201ENSMUST00000160279 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Riok3Q9DBU3 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Riok3Q9DBU3 Gm20540-201ENSMUST00000172972 799 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Riok3Q9DBU3 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Riok3Q9DBU3 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Riok3Q9DBU3 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Riok3Q9DBU3 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Riok3Q9DBU3 Gm20813-201ENSMUST00000186646 705 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Riok3Q9DBU3 Gm20921-201ENSMUST00000188265 652 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Riok3Q9DBU3 Gm21617-201ENSMUST00000188297 691 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Riok3Q9DBU3 Gm37383-201ENSMUST00000191750 745 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Riok3Q9DBU3 Gm32051-201ENSMUST00000196818 709 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Riok3Q9DBU3 Gm42620-201ENSMUST00000197715 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Riok3Q9DBU3 Gm43040-201ENSMUST00000202399 558 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Riok3Q9DBU3 Gm45075-201ENSMUST00000208426 649 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Riok3Q9DBU3 Gm19201-201ENSMUST00000210127 778 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Riok3Q9DBU3 Olfr573-ps1-202ENSMUST00000210571 894 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Riok3Q9DBU3 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Riok3Q9DBU3 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Riok3Q9DBU3 Spink14-201ENSMUST00000060328 566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Riok3Q9DBU3 Olfr573-ps1-201ENSMUST00000064830 888 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Riok3Q9DBU3 Tas2r129-201ENSMUST00000070991 965 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Riok3Q9DBU3 Vmn1r177-201ENSMUST00000073967 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Riok3Q9DBU3 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Riok3Q9DBU3 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Riok3Q9DBU3 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Riok3Q9DBU3 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Riok3Q9DBU3 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Riok3Q9DBU3 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Riok3Q9DBU3 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Riok3Q9DBU3 Gm10764-202ENSMUST00000220397 2335 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Riok3Q9DBU3 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Riok3Q9DBU3 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Riok3Q9DBU3 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Riok3Q9DBU3 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Riok3Q9DBU3 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Riok3Q9DBU3 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Riok3Q9DBU3 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Riok3Q9DBU3 Pla2g4c-ps-201ENSMUST00000204668 1364 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Riok3Q9DBU3 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Riok3Q9DBU3 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Riok3Q9DBU3 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Riok3Q9DBU3 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Riok3Q9DBU3 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Riok3Q9DBU3 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Riok3Q9DBU3 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Riok3Q9DBU3 Grb2-204ENSMUST00000106499 2333 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Riok3Q9DBU3 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Riok3Q9DBU3 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Riok3Q9DBU3 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Riok3Q9DBU3 Gm28687-201ENSMUST00000187203 1494 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Riok3Q9DBU3 Gm28074-201ENSMUST00000190424 1497 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Riok3Q9DBU3 Gm29373-201ENSMUST00000190660 1494 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Riok3Q9DBU3 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Riok3Q9DBU3 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Riok3Q9DBU3 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Riok3Q9DBU3 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Riok3Q9DBU3 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Riok3Q9DBU3 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Riok3Q9DBU3 Chn2-203ENSMUST00000114401 1269 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Riok3Q9DBU3 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Riok3Q9DBU3 Gm9208-201ENSMUST00000120468 948 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Riok3Q9DBU3 Gm25052-201ENSMUST00000122661 158 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Riok3Q9DBU3 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Riok3Q9DBU3 Gm11267-201ENSMUST00000137477 1071 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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