Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 A630052C17Rik-201ENSMUST00000129876 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Gpr68-201ENSMUST00000053668 3099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Wars-205ENSMUST00000161410 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Dok4-204ENSMUST00000212810 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Ocstamp-201ENSMUST00000029213 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Apobec3-204ENSMUST00000175714 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Cntrl-201ENSMUST00000028235 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Pde2a-201ENSMUST00000163751 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Col11a1-201ENSMUST00000092155 7667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Rxfp2-201ENSMUST00000065745 2539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Gm13920-201ENSMUST00000146134 1663 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Gpr35-202ENSMUST00000064480 3409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Eno2-201ENSMUST00000004378 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Dysf-211ENSMUST00000168387 6501 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Slco5a1-201ENSMUST00000115402 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Phtf1os-201ENSMUST00000160110 4046 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 A430010J10Rik-201ENSMUST00000054470 408 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Rasgef1a-203ENSMUST00000203804 2183 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Zfp932-203ENSMUST00000112540 2081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 D030055H07Rik-202ENSMUST00000150953 4325 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Tbpl1-202ENSMUST00000127698 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Atad5-201ENSMUST00000017694 7272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Myo18a-223ENSMUST00000169105 6475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Cd163-201ENSMUST00000032234 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Txlng-201ENSMUST00000041370 3862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Siglec1-203ENSMUST00000110227 5790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Mpp1-202ENSMUST00000114091 1558 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Ccdc97Q9DBT3 Vmn1r184-207ENSMUST00000228369 6361 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc97Q9DBT3 Pdp2-201ENSMUST00000059588 5692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc97Q9DBT3 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc97Q9DBT3 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc97Q9DBT3 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc97Q9DBT3 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc97Q9DBT3 Slc1a2-202ENSMUST00000080210 11595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc97Q9DBT3 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc97Q9DBT3 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc97Q9DBT3 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc97Q9DBT3 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Ccdc97Q9DBT3 Ern1-201ENSMUST00000001059 6946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
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