Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Vsir-202ENSMUST00000105459 1290 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Bloc1s1-205ENSMUST00000153731 613 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Gm25830-201ENSMUST00000158923 132 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Gm15524-201ENSMUST00000159874 463 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Gm4862-201ENSMUST00000170405 438 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Gm26555-201ENSMUST00000180452 1037 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 C730036E19Rik-201ENSMUST00000188305 1102 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
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Smg9Q9DB90 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Gm37365-201ENSMUST00000193109 409 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
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Smg9Q9DB90 Gm3433-201ENSMUST00000210149 1058 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Gm6390-201ENSMUST00000215034 589 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Olfr1233-203ENSMUST00000215469 1205 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 AC156568.1-201ENSMUST00000223018 712 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Aimp1-201ENSMUST00000029663 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Mnd1-201ENSMUST00000047368 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Olfr1395-201ENSMUST00000059379 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 4921508M14Rik-201ENSMUST00000061679 1099 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
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Smg9Q9DB90 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Zfp1-202ENSMUST00000211926 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
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Smg9Q9DB90 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Gm29684-201ENSMUST00000220248 1982 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
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Smg9Q9DB90 Rian-215ENSMUST00000183180 633 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 1700065I16Rik-201ENSMUST00000185277 512 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Gm25053-202ENSMUST00000199731 132 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Gm6423-201ENSMUST00000204315 934 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Gm18204-201ENSMUST00000209835 793 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Gm37419-201ENSMUST00000210705 114 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 AC134248.1-201ENSMUST00000216113 1176 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 CT573086.4-201ENSMUST00000226729 342 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Smg9Q9DB90 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
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