Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB40

Med27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, mousemouse

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Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med27Q9DB40 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 AC155245.1-201ENSMUST00000222266 1804 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Rnf144b-201ENSMUST00000068891 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Dmbx1-203ENSMUST00000124071 4017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Fnbp1l-201ENSMUST00000162409 5198 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Ly75-201ENSMUST00000028362 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Arid2-201ENSMUST00000096250 8507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Trgv2-201ENSMUST00000103563 491 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Gm18539-201ENSMUST00000204745 1090 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Itgax-203ENSMUST00000205460 1215 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 AC159002.1-201ENSMUST00000226714 924 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Cbfa2t2-204ENSMUST00000109725 6080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Ccdc191-201ENSMUST00000122014 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Cnot8-202ENSMUST00000108843 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Mup-ps29-201ENSMUST00000122281 202 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Gm11457-203ENSMUST00000146846 676 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Gm12907-201ENSMUST00000148027 507 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms