Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB28

Pop5, Ribonuclease P/MRP protein subunit POP5, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop5Q9DB28 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Fam47e-202ENSMUST00000131166 1500 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Pou6f1-204ENSMUST00000176271 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Furin-202ENSMUST00000120753 4332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Gm17151-201ENSMUST00000105760 367 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Mir1896-201ENSMUST00000122641 81 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Gm34973-201ENSMUST00000217087 572 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Nipbl-201ENSMUST00000052965 8815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Ribc2-201ENSMUST00000023067 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 1500012K07Rik-201ENSMUST00000181846 2345 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Slc9a8-202ENSMUST00000073873 4429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Lcorl-205ENSMUST00000121573 2378 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Cep112-213ENSMUST00000150863 3453 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Rsrc2-202ENSMUST00000057795 2270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Acsl4-201ENSMUST00000033634 5280 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Trmt12-201ENSMUST00000036937 4454 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Top3a-204ENSMUST00000120417 2318 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Vwa5b2-202ENSMUST00000096197 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Trim16-202ENSMUST00000072639 1929 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Dcun1d2-206ENSMUST00000203604 2112 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Rin1-208ENSMUST00000225427 4503 ntAPPRIS P2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms