Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T0

Fam3a, Protein FAM3A, mousemouse

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam3aQ9D8T0 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fam3aQ9D8T0 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Fam3aQ9D8T0 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fam3aQ9D8T0 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fam3aQ9D8T0 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fam3aQ9D8T0 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fam3aQ9D8T0 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fam3aQ9D8T0 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Fam3aQ9D8T0 U2af1l4-218ENSMUST00000166960 747 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fam3aQ9D8T0 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fam3aQ9D8T0 Mrpl20-206ENSMUST00000185148 494 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fam3aQ9D8T0 Gm28306-201ENSMUST00000191315 529 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fam3aQ9D8T0 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Fam3aQ9D8T0 Gm30946-201ENSMUST00000198288 724 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Fam3aQ9D8T0 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Fam3aQ9D8T0 Cldnd2-202ENSMUST00000206839 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fam3aQ9D8T0 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Fam3aQ9D8T0 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Fam3aQ9D8T0 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fam3aQ9D8T0 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Fam3aQ9D8T0 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fam3aQ9D8T0 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Fam3aQ9D8T0 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fam3aQ9D8T0 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fam3aQ9D8T0 Ndrg4-203ENSMUST00000080666 2738 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fam3aQ9D8T0 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fam3aQ9D8T0 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fam3aQ9D8T0 Epha7-204ENSMUST00000108194 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fam3aQ9D8T0 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fam3aQ9D8T0 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fam3aQ9D8T0 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fam3aQ9D8T0 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fam3aQ9D8T0 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fam3aQ9D8T0 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fam3aQ9D8T0 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fam3aQ9D8T0 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Fam3aQ9D8T0 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fam3aQ9D8T0 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fam3aQ9D8T0 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fam3aQ9D8T0 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fam3aQ9D8T0 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Fam3aQ9D8T0 Slc25a25-202ENSMUST00000052119 3529 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fam3aQ9D8T0 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fam3aQ9D8T0 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fam3aQ9D8T0 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fam3aQ9D8T0 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fam3aQ9D8T0 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fam3aQ9D8T0 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fam3aQ9D8T0 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fam3aQ9D8T0 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fam3aQ9D8T0 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Fam3aQ9D8T0 1700021P04Rik-201ENSMUST00000178667 659 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fam3aQ9D8T0 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Fam3aQ9D8T0 Gm29261-201ENSMUST00000188535 678 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fam3aQ9D8T0 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fam3aQ9D8T0 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fam3aQ9D8T0 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fam3aQ9D8T0 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Fam3aQ9D8T0 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fam3aQ9D8T0 AC122024.3-201ENSMUST00000217719 294 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Fam3aQ9D8T0 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fam3aQ9D8T0 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Fam3aQ9D8T0 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fam3aQ9D8T0 Cenpu-202ENSMUST00000093518 783 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Fam3aQ9D8T0 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fam3aQ9D8T0 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fam3aQ9D8T0 Bbs2-201ENSMUST00000034206 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fam3aQ9D8T0 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fam3aQ9D8T0 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fam3aQ9D8T0 C530044C16Rik-201ENSMUST00000204275 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fam3aQ9D8T0 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fam3aQ9D8T0 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fam3aQ9D8T0 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fam3aQ9D8T0 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fam3aQ9D8T0 Magee2-201ENSMUST00000033575 2316 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fam3aQ9D8T0 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fam3aQ9D8T0 AC149588.2-201ENSMUST00000228182 1859 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Fam3aQ9D8T0 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fam3aQ9D8T0 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fam3aQ9D8T0 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fam3aQ9D8T0 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fam3aQ9D8T0 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fam3aQ9D8T0 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fam3aQ9D8T0 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fam3aQ9D8T0 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fam3aQ9D8T0 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fam3aQ9D8T0 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fam3aQ9D8T0 Gm8899-201ENSMUST00000214635 1332 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Fam3aQ9D8T0 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Fam3aQ9D8T0 Sec24d-201ENSMUST00000047923 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Fam3aQ9D8T0 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Fam3aQ9D8T0 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Fam3aQ9D8T0 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Fam3aQ9D8T0 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Fam3aQ9D8T0 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Fam3aQ9D8T0 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Fam3aQ9D8T0 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Fam3aQ9D8T0 Gm8876-201ENSMUST00000120768 1122 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Fam3aQ9D8T0 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms