Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8K3

Derl3, Derlin-3, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Derl3Q9D8K3 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Derl3Q9D8K3 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Derl3Q9D8K3 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Derl3Q9D8K3 Tbl3-202ENSMUST00000126319 5226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Derl3Q9D8K3 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Derl3Q9D8K3 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Derl3Q9D8K3 Myo15-203ENSMUST00000094135 11715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Derl3Q9D8K3 Zfp605-202ENSMUST00000112528 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Derl3Q9D8K3 Piezo2-202ENSMUST00000047480 10724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Derl3Q9D8K3 Gm26737-201ENSMUST00000181106 2151 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Derl3Q9D8K3 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Derl3Q9D8K3 Dhx40-201ENSMUST00000018569 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Derl3Q9D8K3 Faim2-201ENSMUST00000023750 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Derl3Q9D8K3 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Derl3Q9D8K3 Gm43307-201ENSMUST00000199465 2371 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Derl3Q9D8K3 Rpap1-201ENSMUST00000048493 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Derl3Q9D8K3 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Derl3Q9D8K3 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Derl3Q9D8K3 Tfap2b-204ENSMUST00000187754 3023 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Derl3Q9D8K3 Fbln2-202ENSMUST00000113498 4644 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Derl3Q9D8K3 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Derl3Q9D8K3 Sema3b-203ENSMUST00000102530 3410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Derl3Q9D8K3 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Derl3Q9D8K3 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Derl3Q9D8K3 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Derl3Q9D8K3 Ddr1-201ENSMUST00000003628 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Derl3Q9D8K3 Pgf-201ENSMUST00000004913 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Derl3Q9D8K3 Gm10643-201ENSMUST00000098592 1577 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Derl3Q9D8K3 Amotl1-201ENSMUST00000013220 8957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Derl3Q9D8K3 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Derl3Q9D8K3 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Derl3Q9D8K3 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Derl3Q9D8K3 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Derl3Q9D8K3 Man2c1-201ENSMUST00000034836 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Derl3Q9D8K3 Tro-201ENSMUST00000087253 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Derl3Q9D8K3 Axin2-202ENSMUST00000106711 2551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Derl3Q9D8K3 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Derl3Q9D8K3 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Derl3Q9D8K3 Tnfrsf9-205ENSMUST00000116257 2115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Derl3Q9D8K3 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Derl3Q9D8K3 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Derl3Q9D8K3 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Derl3Q9D8K3 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Derl3Q9D8K3 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Derl3Q9D8K3 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Derl3Q9D8K3 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Derl3Q9D8K3 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Derl3Q9D8K3 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Derl3Q9D8K3 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Derl3Q9D8K3 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Derl3Q9D8K3 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Derl3Q9D8K3 D630029K05Rik-201ENSMUST00000033651 2133 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Derl3Q9D8K3 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Derl3Q9D8K3 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Derl3Q9D8K3 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Derl3Q9D8K3 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Derl3Q9D8K3 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Derl3Q9D8K3 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Derl3Q9D8K3 Dgkh-201ENSMUST00000074729 3967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Derl3Q9D8K3 Arhgap33-204ENSMUST00000207860 4396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Derl3Q9D8K3 Arid2-201ENSMUST00000096250 8507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Derl3Q9D8K3 Tnfsf13b-203ENSMUST00000207792 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Derl3Q9D8K3 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Derl3Q9D8K3 Csgalnact1-201ENSMUST00000078350 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Derl3Q9D8K3 C130021I20Rik-201ENSMUST00000147294 3693 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Derl3Q9D8K3 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Derl3Q9D8K3 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Derl3Q9D8K3 Setmar-201ENSMUST00000049246 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Derl3Q9D8K3 Gfi1b-204ENSMUST00000164290 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Derl3Q9D8K3 Actn2-201ENSMUST00000064204 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Derl3Q9D8K3 Cdh1-203ENSMUST00000167688 3203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Derl3Q9D8K3 Lhx9-202ENSMUST00000046870 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Derl3Q9D8K3 Cdca2-207ENSMUST00000163100 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Derl3Q9D8K3 Msrb3-201ENSMUST00000092143 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Derl3Q9D8K3 Gm26822-201ENSMUST00000181732 3374 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Derl3Q9D8K3 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Derl3Q9D8K3 Sp100-201ENSMUST00000054279 1978 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Derl3Q9D8K3 Zfp217-202ENSMUST00000109155 5670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Derl3Q9D8K3 Tia1-201ENSMUST00000095752 3130 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Derl3Q9D8K3 Ern2-201ENSMUST00000033153 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Derl3Q9D8K3 Hyou1-206ENSMUST00000161318 4489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Derl3Q9D8K3 Fam161a-201ENSMUST00000058269 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Derl3Q9D8K3 Pax3-201ENSMUST00000004994 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Derl3Q9D8K3 Anks1b-233ENSMUST00000183156 4248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Derl3Q9D8K3 Camk2a-203ENSMUST00000102888 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Derl3Q9D8K3 Dcaf11-206ENSMUST00000128490 2660 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Derl3Q9D8K3 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Derl3Q9D8K3 Syncrip-208ENSMUST00000174282 3404 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Derl3Q9D8K3 Prom2-202ENSMUST00000103214 4190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Derl3Q9D8K3 Arhgap36-202ENSMUST00000114904 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Derl3Q9D8K3 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Derl3Q9D8K3 Asb1-201ENSMUST00000027538 5826 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Derl3Q9D8K3 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Derl3Q9D8K3 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Derl3Q9D8K3 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Derl3Q9D8K3 Vcan-202ENSMUST00000109544 5702 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Derl3Q9D8K3 Gm40634-201ENSMUST00000214129 2001 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Derl3Q9D8K3 Mei4-203ENSMUST00000189832 2578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Derl3Q9D8K3 Cep112-201ENSMUST00000061287 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Derl3Q9D8K3 Pabpc1l-201ENSMUST00000067715 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms