Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Zfp384-206ENSMUST00000112425 2691 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Arpc3-202ENSMUST00000102525 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Gm10912-201ENSMUST00000104891 1661 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Cd55-201ENSMUST00000027650 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Snw1-201ENSMUST00000021428 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Tm9sf1-202ENSMUST00000120041 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Pex13-201ENSMUST00000020523 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Gnl2-201ENSMUST00000030684 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Gpcpd1-202ENSMUST00000060955 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Rad51ap2-201ENSMUST00000124065 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Cldn22Q9D7U6 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
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