Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop56Q9D6Z1 Ccdc93-202ENSMUST00000112621 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Fsd2-201ENSMUST00000042318 3985 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Eya1-209ENSMUST00000190337 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Wipf2-201ENSMUST00000037480 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 H2-Ob-201ENSMUST00000095342 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Nfkbiz-202ENSMUST00000096026 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Irf9-202ENSMUST00000130697 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Bcl7a-202ENSMUST00000117971 4642 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Dhx34-202ENSMUST00000118795 4076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Edaradd-201ENSMUST00000179308 6668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 AC164092.1-201ENSMUST00000215635 2232 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Olfr742-203ENSMUST00000217437 2244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Gm11685-201ENSMUST00000141559 1332 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Tbata-209ENSMUST00000148181 1017 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Gm43037-201ENSMUST00000196808 250 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Gm8752-201ENSMUST00000173427 1694 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Sept9-203ENSMUST00000100193 2924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Ttc23-201ENSMUST00000032774 2492 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Olfr1349-207ENSMUST00000216447 2448 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Gm16702-201ENSMUST00000181180 2384 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Pear1-201ENSMUST00000029714 4260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Nfkbiz-201ENSMUST00000036273 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Gm5703-201ENSMUST00000186658 3973 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Ncam1-203ENSMUST00000192584 2525 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 B230312C02Rik-201ENSMUST00000145549 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Astn1-205ENSMUST00000193042 7248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Atxn1l-201ENSMUST00000093162 7526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Scn9a-201ENSMUST00000100063 9813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Scn9a-202ENSMUST00000100064 9840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Atg9a-205ENSMUST00000188347 4041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Stk38-201ENSMUST00000009138 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Pla2g6-203ENSMUST00000172403 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Pigq-219ENSMUST00000208071 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Gm45682-201ENSMUST00000209434 1256 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Ikbkg-204ENSMUST00000114128 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Sptb-202ENSMUST00000166101 8084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Nop56Q9D6Z1 Milr1-202ENSMUST00000106794 1514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms