Protein–RNA interactions for Protein: Q9D232

Spns3, Protein spinster homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spns3Q9D232 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Spns3Q9D232 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Spns3Q9D232 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Spns3Q9D232 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Spns3Q9D232 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Spns3Q9D232 Ccnt2-201ENSMUST00000027587 6738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Spns3Q9D232 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Spns3Q9D232 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Spns3Q9D232 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Spns3Q9D232 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Spns3Q9D232 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Spns3Q9D232 Zfp384-204ENSMUST00000088308 2875 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Spns3Q9D232 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Spns3Q9D232 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Spns3Q9D232 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Spns3Q9D232 Acin1-203ENSMUST00000111484 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Spns3Q9D232 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Spns3Q9D232 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Spns3Q9D232 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Spns3Q9D232 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Spns3Q9D232 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Spns3Q9D232 Ntm-201ENSMUST00000075069 3022 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Spns3Q9D232 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Spns3Q9D232 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Spns3Q9D232 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Spns3Q9D232 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Spns3Q9D232 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Spns3Q9D232 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Spns3Q9D232 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Spns3Q9D232 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Spns3Q9D232 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Spns3Q9D232 Zfp133-ps-204ENSMUST00000149523 424 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Spns3Q9D232 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Spns3Q9D232 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Spns3Q9D232 Gstt3-203ENSMUST00000173537 687 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Spns3Q9D232 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Spns3Q9D232 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Spns3Q9D232 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Spns3Q9D232 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Spns3Q9D232 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Spns3Q9D232 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Spns3Q9D232 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Spns3Q9D232 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Spns3Q9D232 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Spns3Q9D232 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Spns3Q9D232 Hsd17b3-201ENSMUST00000039832 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Spns3Q9D232 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Spns3Q9D232 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Spns3Q9D232 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Spns3Q9D232 Slc37a4-201ENSMUST00000165839 2086 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Spns3Q9D232 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Spns3Q9D232 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Spns3Q9D232 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Spns3Q9D232 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Spns3Q9D232 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Spns3Q9D232 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Spns3Q9D232 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Spns3Q9D232 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Spns3Q9D232 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Spns3Q9D232 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Spns3Q9D232 Gp2-201ENSMUST00000033255 1993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Spns3Q9D232 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Spns3Q9D232 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Spns3Q9D232 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Spns3Q9D232 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Spns3Q9D232 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Spns3Q9D232 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Spns3Q9D232 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Spns3Q9D232 Fam83a-202ENSMUST00000160942 2876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Spns3Q9D232 Apol9a-202ENSMUST00000089452 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Spns3Q9D232 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Spns3Q9D232 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Spns3Q9D232 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Spns3Q9D232 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Spns3Q9D232 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Spns3Q9D232 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Spns3Q9D232 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Spns3Q9D232 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Spns3Q9D232 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Spns3Q9D232 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Spns3Q9D232 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Spns3Q9D232 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Spns3Q9D232 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Spns3Q9D232 Gm42588-201ENSMUST00000200538 1297 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Spns3Q9D232 Dcun1d2-206ENSMUST00000203604 2112 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Spns3Q9D232 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Spns3Q9D232 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Spns3Q9D232 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Spns3Q9D232 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Spns3Q9D232 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Spns3Q9D232 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Spns3Q9D232 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Spns3Q9D232 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Spns3Q9D232 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Spns3Q9D232 Rabl2-202ENSMUST00000094056 1322 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Spns3Q9D232 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Spns3Q9D232 C530044C16Rik-201ENSMUST00000204275 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Spns3Q9D232 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Spns3Q9D232 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Spns3Q9D232 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms