Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ83

Mrpl55, 39S ribosomal protein L55, mitochondrial, mousemouse

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Length 127 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl55Q9CZ83 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 Fam53b-206ENSMUST00000106168 3630 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 Grpr-201ENSMUST00000033730 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 B020004J07Rik-202ENSMUST00000106919 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 Cdk5rap1-201ENSMUST00000028990 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 Gm7967-202ENSMUST00000191042 5042 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 Gys1-206ENSMUST00000211150 2681 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 Pla2g4c-201ENSMUST00000043612 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 Arfgef3-201ENSMUST00000019999 5606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 Gm16387-201ENSMUST00000180990 2632 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 Gm43288-201ENSMUST00000197594 2628 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 Gm45161-201ENSMUST00000207316 2263 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 Arxes1-201ENSMUST00000057625 1580 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 Mybpc3-201ENSMUST00000111430 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 Gm15953-201ENSMUST00000117656 1732 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 Zfp109-202ENSMUST00000206362 2932 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 Polq-202ENSMUST00000071452 7290 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 Ptrh2-202ENSMUST00000108022 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 Kif3a-202ENSMUST00000118353 2178 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 Ccdc136-208ENSMUST00000180829 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 Pcdh15-233ENSMUST00000191709 5346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 Dhx38-201ENSMUST00000042601 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 Zer1-201ENSMUST00000044751 4100 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 R3hdm2-218ENSMUST00000170336 3639 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 Ncoa1-209ENSMUST00000220434 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 Prpf8-202ENSMUST00000102510 7249 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 Camk2b-210ENSMUST00000109815 3780 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 Plec-203ENSMUST00000071869 14917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 Zbtb8b-201ENSMUST00000053042 3288 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 Tomt-201ENSMUST00000106969 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 Gmip-202ENSMUST00000123453 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 Ptpn21-201ENSMUST00000085116 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 Casq2-201ENSMUST00000029454 2556 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 Gm38005-201ENSMUST00000194845 2745 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
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Mrpl55Q9CZ83 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 AC154171.2-201ENSMUST00000225219 2652 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 Plpbp-203ENSMUST00000209525 5767 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 Frmd4a-219ENSMUST00000177457 6538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 Parp1-201ENSMUST00000027777 3873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 Olfr222-202ENSMUST00000214351 2474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 Pik3r4-210ENSMUST00000191268 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 Prdm16-206ENSMUST00000105638 8601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 Ebf2-203ENSMUST00000176161 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 Gm44597-202ENSMUST00000203287 3516 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
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