Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX11

Utp23, rRNA-processing protein UTP23 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp23Q9CX11 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Gm14219-201ENSMUST00000120414 288 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Gm22877-201ENSMUST00000175451 105 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 2610027F03Rik-202ENSMUST00000186982 603 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Gm43349-201ENSMUST00000200047 503 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Nudt2-201ENSMUST00000030154 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Krtap19-9b-201ENSMUST00000077715 461 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Rangap1-201ENSMUST00000052374 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Wdr19-204ENSMUST00000203653 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Gm26846-201ENSMUST00000181865 4869 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Gm16323-201ENSMUST00000134920 556 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Gm11457-203ENSMUST00000146846 676 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Nop16-202ENSMUST00000148222 790 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Olfml3-204ENSMUST00000169286 874 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Gm28760-202ENSMUST00000190376 481 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Gm45120-201ENSMUST00000208880 408 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 AC165154.1-201ENSMUST00000226661 340 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Ccdc60-202ENSMUST00000086483 2168 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Platr6-201ENSMUST00000180731 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Utp23Q9CX11 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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