Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC0

Tpbpb, Trophoblast-specific protein beta, mousemouse

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Length 121 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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TpbpbQ9CQC0 Uaca-201ENSMUST00000050183 4428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TpbpbQ9CQC0 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
TpbpbQ9CQC0 Gp2-201ENSMUST00000033255 1993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TpbpbQ9CQC0 Wipf1-203ENSMUST00000102680 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TpbpbQ9CQC0 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TpbpbQ9CQC0 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TpbpbQ9CQC0 Tmem231-201ENSMUST00000034429 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TpbpbQ9CQC0 Ddr1-212ENSMUST00000166980 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TpbpbQ9CQC0 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
TpbpbQ9CQC0 Atp5g1-201ENSMUST00000090541 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TpbpbQ9CQC0 Nod1-202ENSMUST00000168172 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TpbpbQ9CQC0 Gm13652-201ENSMUST00000143898 3412 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TpbpbQ9CQC0 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TpbpbQ9CQC0 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TpbpbQ9CQC0 D030055H07Rik-202ENSMUST00000150953 4325 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TpbpbQ9CQC0 Adam8-202ENSMUST00000106069 3117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TpbpbQ9CQC0 Adam8-201ENSMUST00000026546 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TpbpbQ9CQC0 Olfr370-203ENSMUST00000214156 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
TpbpbQ9CQC0 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TpbpbQ9CQC0 Myo9a-206ENSMUST00000136740 12252 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
TpbpbQ9CQC0 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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TpbpbQ9CQC0 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
TpbpbQ9CQC0 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TpbpbQ9CQC0 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TpbpbQ9CQC0 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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TpbpbQ9CQC0 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TpbpbQ9CQC0 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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TpbpbQ9CQC0 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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TpbpbQ9CQC0 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TpbpbQ9CQC0 Spaar-201ENSMUST00000131248 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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TpbpbQ9CQC0 Mlh3-202ENSMUST00000166821 5420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TpbpbQ9CQC0 1700017B05Rik-201ENSMUST00000034846 4152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TpbpbQ9CQC0 Aebp2-201ENSMUST00000032359 5932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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TpbpbQ9CQC0 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TpbpbQ9CQC0 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TpbpbQ9CQC0 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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TpbpbQ9CQC0 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
TpbpbQ9CQC0 Ap1b1-201ENSMUST00000009234 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TpbpbQ9CQC0 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TpbpbQ9CQC0 Ptprm-201ENSMUST00000037974 5186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TpbpbQ9CQC0 Golm1-201ENSMUST00000022039 3954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TpbpbQ9CQC0 Zmym6-201ENSMUST00000046751 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TpbpbQ9CQC0 Srp54a-207ENSMUST00000110708 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TpbpbQ9CQC0 Nectin4-201ENSMUST00000006578 3636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TpbpbQ9CQC0 Icam1-201ENSMUST00000086399 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TpbpbQ9CQC0 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TpbpbQ9CQC0 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TpbpbQ9CQC0 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TpbpbQ9CQC0 Sept9-203ENSMUST00000100193 2924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TpbpbQ9CQC0 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TpbpbQ9CQC0 Vti1a-201ENSMUST00000095950 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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