Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ73

Pkp2, Plakophilin 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp2Q9CQ73 Zfp872-201ENSMUST00000091508 1395 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pkp2Q9CQ73 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pkp2Q9CQ73 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pkp2Q9CQ73 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pkp2Q9CQ73 Alox5-207ENSMUST00000170186 1929 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pkp2Q9CQ73 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Pkp2Q9CQ73 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pkp2Q9CQ73 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pkp2Q9CQ73 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pkp2Q9CQ73 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pkp2Q9CQ73 Gapdhs-203ENSMUST00000182634 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pkp2Q9CQ73 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pkp2Q9CQ73 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pkp2Q9CQ73 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pkp2Q9CQ73 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pkp2Q9CQ73 9430015G10Rik-202ENSMUST00000105576 1329 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pkp2Q9CQ73 Atp6v1e1-201ENSMUST00000019354 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pkp2Q9CQ73 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pkp2Q9CQ73 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pkp2Q9CQ73 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pkp2Q9CQ73 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pkp2Q9CQ73 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pkp2Q9CQ73 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pkp2Q9CQ73 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pkp2Q9CQ73 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pkp2Q9CQ73 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pkp2Q9CQ73 Syk-202ENSMUST00000118756 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pkp2Q9CQ73 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pkp2Q9CQ73 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pkp2Q9CQ73 Gm10848-201ENSMUST00000192361 1811 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pkp2Q9CQ73 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pkp2Q9CQ73 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pkp2Q9CQ73 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pkp2Q9CQ73 Klk6-201ENSMUST00000107966 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pkp2Q9CQ73 Rad54b-203ENSMUST00000108306 652 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pkp2Q9CQ73 Mup-ps29-201ENSMUST00000122281 202 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Pkp2Q9CQ73 Gm44552-201ENSMUST00000205458 1247 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Pkp2Q9CQ73 Klk1b15-ps-201ENSMUST00000206273 715 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Pkp2Q9CQ73 Retnla-201ENSMUST00000023329 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pkp2Q9CQ73 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pkp2Q9CQ73 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pkp2Q9CQ73 Nxf2-202ENSMUST00000113187 2316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pkp2Q9CQ73 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pkp2Q9CQ73 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Pkp2Q9CQ73 Lrp2bp-201ENSMUST00000066451 1525 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pkp2Q9CQ73 Slc13a5-206ENSMUST00000208912 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pkp2Q9CQ73 Ceacam9-201ENSMUST00000001984 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pkp2Q9CQ73 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Pkp2Q9CQ73 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Pkp2Q9CQ73 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Pkp2Q9CQ73 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Pkp2Q9CQ73 Ppp1r32-201ENSMUST00000038842 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Pkp2Q9CQ73 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Pkp2Q9CQ73 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pkp2Q9CQ73 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pkp2Q9CQ73 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pkp2Q9CQ73 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pkp2Q9CQ73 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pkp2Q9CQ73 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pkp2Q9CQ73 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pkp2Q9CQ73 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pkp2Q9CQ73 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pkp2Q9CQ73 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pkp2Q9CQ73 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pkp2Q9CQ73 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pkp2Q9CQ73 Ighv1-81-201ENSMUST00000103548 351 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pkp2Q9CQ73 Ifitm1-202ENSMUST00000106040 560 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pkp2Q9CQ73 Ifitm1-203ENSMUST00000106042 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pkp2Q9CQ73 Cdk5rap1-202ENSMUST00000109730 1227 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pkp2Q9CQ73 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pkp2Q9CQ73 Gm13019-201ENSMUST00000120000 276 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Pkp2Q9CQ73 Gm12712-201ENSMUST00000120676 801 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Pkp2Q9CQ73 Gm13026-201ENSMUST00000140113 608 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pkp2Q9CQ73 Prdx2-208ENSMUST00000164807 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pkp2Q9CQ73 Gm5529-201ENSMUST00000165691 891 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Pkp2Q9CQ73 Gm24328-201ENSMUST00000175104 67 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Pkp2Q9CQ73 Gm13290-201ENSMUST00000177806 968 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pkp2Q9CQ73 Gm31274-201ENSMUST00000197356 229 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Pkp2Q9CQ73 BC028471-201ENSMUST00000200937 520 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pkp2Q9CQ73 Fcer2a-206ENSMUST00000208438 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pkp2Q9CQ73 Fcer2a-208ENSMUST00000208603 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pkp2Q9CQ73 3110009M11Rik-201ENSMUST00000208647 892 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Pkp2Q9CQ73 AC112146.1-201ENSMUST00000221641 733 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pkp2Q9CQ73 Zmiz1os1-202ENSMUST00000225188 1223 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Pkp2Q9CQ73 Ifitm1-201ENSMUST00000026564 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pkp2Q9CQ73 Olfr889-201ENSMUST00000072290 945 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pkp2Q9CQ73 Uqcc3-201ENSMUST00000096253 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pkp2Q9CQ73 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pkp2Q9CQ73 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pkp2Q9CQ73 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pkp2Q9CQ73 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pkp2Q9CQ73 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pkp2Q9CQ73 Gm5822-201ENSMUST00000161562 1378 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Pkp2Q9CQ73 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pkp2Q9CQ73 Ppp2r2cos-201ENSMUST00000152862 1491 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pkp2Q9CQ73 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pkp2Q9CQ73 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Pkp2Q9CQ73 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pkp2Q9CQ73 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pkp2Q9CQ73 Gm44153-201ENSMUST00000204162 1580 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms