Protein–RNA interactions for Protein: Q99P88

Nup155, Nuclear pore complex protein Nup155, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup155Q99P88 Crygf-201ENSMUST00000027082 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nup155Q99P88 Mrps11-201ENSMUST00000032840 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nup155Q99P88 Taar7a-201ENSMUST00000078532 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nup155Q99P88 Ccdc153-201ENSMUST00000092426 1087 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nup155Q99P88 Taar7b-201ENSMUST00000092658 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nup155Q99P88 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nup155Q99P88 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nup155Q99P88 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nup155Q99P88 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Nup155Q99P88 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nup155Q99P88 Gm20758-201ENSMUST00000220339 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nup155Q99P88 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nup155Q99P88 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nup155Q99P88 4921507G05Rik-201ENSMUST00000181348 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nup155Q99P88 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nup155Q99P88 Tubb1-201ENSMUST00000016399 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nup155Q99P88 Mocs2-216ENSMUST00000184672 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nup155Q99P88 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nup155Q99P88 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nup155Q99P88 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nup155Q99P88 Polr1e-203ENSMUST00000107814 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nup155Q99P88 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nup155Q99P88 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nup155Q99P88 Supt3-201ENSMUST00000050630 1508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nup155Q99P88 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nup155Q99P88 Gm15519-201ENSMUST00000120088 1566 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Nup155Q99P88 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nup155Q99P88 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nup155Q99P88 1700006J14Rik-204ENSMUST00000161511 574 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nup155Q99P88 Bnip2-208ENSMUST00000165389 945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nup155Q99P88 Gm20443-201ENSMUST00000173840 735 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nup155Q99P88 Olfr1358-201ENSMUST00000204477 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nup155Q99P88 Gm44605-201ENSMUST00000206892 949 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Nup155Q99P88 AC122860.1-201ENSMUST00000217669 773 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nup155Q99P88 Gm26782-203ENSMUST00000227103 751 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Nup155Q99P88 Elob-201ENSMUST00000069579 508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nup155Q99P88 Nat8f6-201ENSMUST00000087656 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nup155Q99P88 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nup155Q99P88 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nup155Q99P88 Gm5122-202ENSMUST00000216854 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nup155Q99P88 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nup155Q99P88 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nup155Q99P88 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nup155Q99P88 Ppp2r5c-205ENSMUST00000221715 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nup155Q99P88 Gm19027-201ENSMUST00000187291 1355 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Nup155Q99P88 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Nup155Q99P88 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nup155Q99P88 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nup155Q99P88 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nup155Q99P88 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nup155Q99P88 2610028H24Rik-202ENSMUST00000105415 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nup155Q99P88 Ackr2-202ENSMUST00000214340 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nup155Q99P88 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nup155Q99P88 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nup155Q99P88 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nup155Q99P88 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nup155Q99P88 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nup155Q99P88 Cdip1-202ENSMUST00000117713 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nup155Q99P88 Gm31718-201ENSMUST00000212406 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nup155Q99P88 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nup155Q99P88 Tspan32os-201ENSMUST00000131740 975 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nup155Q99P88 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nup155Q99P88 Gm11634-201ENSMUST00000154147 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nup155Q99P88 Mmp7-201ENSMUST00000018767 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nup155Q99P88 Gm37452-201ENSMUST00000194416 1160 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Nup155Q99P88 Gm33080-201ENSMUST00000205429 172 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Nup155Q99P88 D730050B12Rik-201ENSMUST00000223149 585 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nup155Q99P88 Actg1-201ENSMUST00000062147 876 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nup155Q99P88 Rpl3-201ENSMUST00000081650 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nup155Q99P88 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nup155Q99P88 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nup155Q99P88 Slc25a25-202ENSMUST00000052119 3529 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nup155Q99P88 Ss18l2-206ENSMUST00000215966 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nup155Q99P88 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nup155Q99P88 Gm11033-201ENSMUST00000127757 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nup155Q99P88 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nup155Q99P88 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Nup155Q99P88 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nup155Q99P88 1110051M20Rik-202ENSMUST00000094835 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nup155Q99P88 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nup155Q99P88 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nup155Q99P88 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nup155Q99P88 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nup155Q99P88 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nup155Q99P88 Ido1-202ENSMUST00000110667 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nup155Q99P88 Zw10-201ENSMUST00000034803 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nup155Q99P88 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nup155Q99P88 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nup155Q99P88 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nup155Q99P88 Vcp-rs-201ENSMUST00000120233 2406 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Nup155Q99P88 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nup155Q99P88 Tnfrsf9-203ENSMUST00000105671 1278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nup155Q99P88 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Nup155Q99P88 Gm14113-201ENSMUST00000121399 976 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Nup155Q99P88 Gm44511-201ENSMUST00000204394 678 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nup155Q99P88 Gm44511-202ENSMUST00000204423 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nup155Q99P88 Gm17749-201ENSMUST00000216282 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nup155Q99P88 Fam83a-201ENSMUST00000050374 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nup155Q99P88 Tnfrsf9-202ENSMUST00000060901 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nup155Q99P88 Gm6040-201ENSMUST00000095430 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.1 ms