Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac9Q99N13 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hdac9Q99N13 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hdac9Q99N13 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hdac9Q99N13 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hdac9Q99N13 Mgl2-205ENSMUST00000165951 1635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hdac9Q99N13 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hdac9Q99N13 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hdac9Q99N13 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hdac9Q99N13 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hdac9Q99N13 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hdac9Q99N13 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hdac9Q99N13 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Hdac9Q99N13 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hdac9Q99N13 Gm10614-201ENSMUST00000181414 2538 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hdac9Q99N13 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hdac9Q99N13 Trgv2-201ENSMUST00000103563 491 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hdac9Q99N13 Fcgr2b-203ENSMUST00000159688 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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Hdac9Q99N13 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Hdac9Q99N13 Gm38324-201ENSMUST00000194390 411 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hdac9Q99N13 Gpr137b-ps-202ENSMUST00000220647 1159 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Hdac9Q99N13 Eef1akmt1-201ENSMUST00000022518 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hdac9Q99N13 CT025689.1-201ENSMUST00000225214 283 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Hdac9Q99N13 Bloc1s1-201ENSMUST00000026405 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hdac9Q99N13 Gm9791-201ENSMUST00000060997 447 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
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Hdac9Q99N13 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hdac9Q99N13 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hdac9Q99N13 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hdac9Q99N13 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hdac9Q99N13 Gm13871-202ENSMUST00000107319 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hdac9Q99N13 Gm11757-202ENSMUST00000107321 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hdac9Q99N13 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hdac9Q99N13 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hdac9Q99N13 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hdac9Q99N13 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hdac9Q99N13 Ikzf2-204ENSMUST00000188110 1365 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hdac9Q99N13 Ikzf2-208ENSMUST00000190855 1359 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hdac9Q99N13 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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Hdac9Q99N13 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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Hdac9Q99N13 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hdac9Q99N13 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hdac9Q99N13 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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Hdac9Q99N13 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hdac9Q99N13 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hdac9Q99N13 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hdac9Q99N13 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hdac9Q99N13 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hdac9Q99N13 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hdac9Q99N13 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hdac9Q99N13 Uqcrc2-201ENSMUST00000033176 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hdac9Q99N13 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hdac9Q99N13 Il1rn-202ENSMUST00000114485 728 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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Hdac9Q99N13 Gm11642-201ENSMUST00000150442 440 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hdac9Q99N13 Gm11728-201ENSMUST00000150628 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hdac9Q99N13 Gm17115-201ENSMUST00000164075 885 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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Hdac9Q99N13 Gm31557-202ENSMUST00000213995 722 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hdac9Q99N13 AC122860.1-201ENSMUST00000217669 773 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hdac9Q99N13 AC159002.1-201ENSMUST00000226714 924 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Hdac9Q99N13 Vmn1r220-201ENSMUST00000072385 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hdac9Q99N13 Gm7589-201ENSMUST00000085631 534 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Hdac9Q99N13 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hdac9Q99N13 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hdac9Q99N13 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hdac9Q99N13 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hdac9Q99N13 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hdac9Q99N13 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Hdac9Q99N13 Gps2-202ENSMUST00000072581 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hdac9Q99N13 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hdac9Q99N13 4833422M21Rik-203ENSMUST00000181747 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hdac9Q99N13 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hdac9Q99N13 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hdac9Q99N13 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hdac9Q99N13 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hdac9Q99N13 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hdac9Q99N13 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hdac9Q99N13 Ppp2r2cos-201ENSMUST00000152862 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hdac9Q99N13 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hdac9Q99N13 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hdac9Q99N13 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Hdac9Q99N13 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
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