Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ7

Rcbtb2, RCC1 and BTB domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcbtb2Q99LJ7 Spata31d1a-203ENSMUST00000224982 5325 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rcbtb2Q99LJ7 Tacr1-201ENSMUST00000032122 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rcbtb2Q99LJ7 Ccdc191-201ENSMUST00000122014 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rcbtb2Q99LJ7 Nup50-201ENSMUST00000165443 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rcbtb2Q99LJ7 Azin1-203ENSMUST00000110329 4217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rcbtb2Q99LJ7 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rcbtb2Q99LJ7 Mroh8-202ENSMUST00000143663 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rcbtb2Q99LJ7 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rcbtb2Q99LJ7 Tmem231-201ENSMUST00000034429 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rcbtb2Q99LJ7 Gm45140-202ENSMUST00000204419 5061 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rcbtb2Q99LJ7 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rcbtb2Q99LJ7 Cacna1c-219ENSMUST00000189389 6603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rcbtb2Q99LJ7 Arpc3-202ENSMUST00000102525 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rcbtb2Q99LJ7 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rcbtb2Q99LJ7 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rcbtb2Q99LJ7 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rcbtb2Q99LJ7 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rcbtb2Q99LJ7 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rcbtb2Q99LJ7 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rcbtb2Q99LJ7 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rcbtb2Q99LJ7 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Rcbtb2Q99LJ7 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rcbtb2Q99LJ7 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rcbtb2Q99LJ7 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Rcbtb2Q99LJ7 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Rcbtb2Q99LJ7 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rcbtb2Q99LJ7 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rcbtb2Q99LJ7 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Rcbtb2Q99LJ7 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Rcbtb2Q99LJ7 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rcbtb2Q99LJ7 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rcbtb2Q99LJ7 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rcbtb2Q99LJ7 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Rcbtb2Q99LJ7 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Rcbtb2Q99LJ7 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rcbtb2Q99LJ7 Sec24d-201ENSMUST00000047923 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rcbtb2Q99LJ7 Gm8752-201ENSMUST00000173427 1694 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Rcbtb2Q99LJ7 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Rcbtb2Q99LJ7 Tbc1d17-201ENSMUST00000047085 8750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rcbtb2Q99LJ7 Zfp174-201ENSMUST00000041778 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rcbtb2Q99LJ7 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Rcbtb2Q99LJ7 Magt1-204ENSMUST00000151689 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Rcbtb2Q99LJ7 Rpap1-201ENSMUST00000048493 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Rcbtb2Q99LJ7 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Rcbtb2Q99LJ7 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Rcbtb2Q99LJ7 Sept9-203ENSMUST00000100193 2924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Rcbtb2Q99LJ7 Rhoj-203ENSMUST00000118966 4892 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Rcbtb2Q99LJ7 Gm42641-202ENSMUST00000160217 4248 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Rcbtb2Q99LJ7 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Rcbtb2Q99LJ7 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Rcbtb2Q99LJ7 Cct3-204ENSMUST00000164166 1804 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Rcbtb2Q99LJ7 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Rcbtb2Q99LJ7 Synpo2l-201ENSMUST00000057090 4394 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Rcbtb2Q99LJ7 Stk4-201ENSMUST00000018353 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Rcbtb2Q99LJ7 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rcbtb2Q99LJ7 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rcbtb2Q99LJ7 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rcbtb2Q99LJ7 D130019J16Rik-201ENSMUST00000193261 2158 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Rcbtb2Q99LJ7 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rcbtb2Q99LJ7 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rcbtb2Q99LJ7 Ppat-202ENSMUST00000140076 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rcbtb2Q99LJ7 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rcbtb2Q99LJ7 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Rcbtb2Q99LJ7 Mybph-202ENSMUST00000191577 2320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rcbtb2Q99LJ7 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rcbtb2Q99LJ7 Tab1-201ENSMUST00000023050 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rcbtb2Q99LJ7 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rcbtb2Q99LJ7 D630003M21Rik-201ENSMUST00000046944 3910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rcbtb2Q99LJ7 Rad1-202ENSMUST00000100775 4085 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rcbtb2Q99LJ7 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rcbtb2Q99LJ7 Krba1-201ENSMUST00000031815 3685 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rcbtb2Q99LJ7 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rcbtb2Q99LJ7 Krt75-201ENSMUST00000042957 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rcbtb2Q99LJ7 Zfp384-204ENSMUST00000088308 2875 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rcbtb2Q99LJ7 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rcbtb2Q99LJ7 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rcbtb2Q99LJ7 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Rcbtb2Q99LJ7 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Rcbtb2Q99LJ7 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Rcbtb2Q99LJ7 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Rcbtb2Q99LJ7 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rcbtb2Q99LJ7 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Rcbtb2Q99LJ7 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rcbtb2Q99LJ7 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rcbtb2Q99LJ7 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Rcbtb2Q99LJ7 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rcbtb2Q99LJ7 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Rcbtb2Q99LJ7 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Rcbtb2Q99LJ7 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Rcbtb2Q99LJ7 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Rcbtb2Q99LJ7 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Rcbtb2Q99LJ7 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Rcbtb2Q99LJ7 S1pr2-201ENSMUST00000054197 6394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rcbtb2Q99LJ7 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Rcbtb2Q99LJ7 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Rcbtb2Q99LJ7 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rcbtb2Q99LJ7 Sez6l-201ENSMUST00000075387 6055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rcbtb2Q99LJ7 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rcbtb2Q99LJ7 Lactb2-201ENSMUST00000027071 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rcbtb2Q99LJ7 Dhdds-201ENSMUST00000012262 3133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms