Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN2

Ciao1, Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ciao1Q99KN2 Ccdc78-201ENSMUST00000095500 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 Ceacam1-205ENSMUST00000206171 1722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 Ikbkg-204ENSMUST00000114128 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 2300003K06Rik-201ENSMUST00000105054 1265 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 Ice2-202ENSMUST00000117246 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 Gm13019-201ENSMUST00000120000 276 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 Gm27191-201ENSMUST00000145973 448 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 2210406O10Rik-203ENSMUST00000149687 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 Gm23218-201ENSMUST00000158124 276 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 Gm27003-201ENSMUST00000182590 497 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 Gm37013-201ENSMUST00000194544 313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 AC165249.1-202ENSMUST00000217990 734 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 AC156568.1-201ENSMUST00000223018 712 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 4930449E01Rik-201ENSMUST00000022711 595 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 Spata46-201ENSMUST00000056991 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 Cnot8-202ENSMUST00000108843 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ciao1Q99KN2 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Apoc3-202ENSMUST00000118649 453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 AU015836-201ENSMUST00000120624 674 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Spaca9-202ENSMUST00000124840 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Gm15935-201ENSMUST00000141004 607 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Gm5529-201ENSMUST00000165691 891 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Gm20441-201ENSMUST00000173512 756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Dusp3-207ENSMUST00000176261 496 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Gm19166-201ENSMUST00000196041 1063 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Gm43912-201ENSMUST00000204352 538 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 D830035M03Rik-201ENSMUST00000213677 1041 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Akr1c18-201ENSMUST00000021635 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 AC113282.2-201ENSMUST00000224012 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 AC113282.3-201ENSMUST00000224757 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 AC154572.1-201ENSMUST00000226098 1204 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Klhdc10-206ENSMUST00000144272 1387 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Mterf3-201ENSMUST00000021991 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 C530044C16Rik-201ENSMUST00000204275 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Ung-203ENSMUST00000112275 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 AC090962.2-201ENSMUST00000225064 1801 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Gm43482-201ENSMUST00000202797 1861 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Gm6158-201ENSMUST00000109467 904 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Gm13351-201ENSMUST00000118087 414 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Gm5944-201ENSMUST00000118182 1001 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Rbmx2-ps-201ENSMUST00000119377 930 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 4930507D10Rik-201ENSMUST00000137411 1152 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Gm24074-201ENSMUST00000158178 260 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Gm17135-201ENSMUST00000167009 564 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Gm22877-201ENSMUST00000175451 105 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Gm28032-201ENSMUST00000184104 96 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Gm43401-201ENSMUST00000198829 394 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 BC028471-201ENSMUST00000200937 520 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Gm44216-201ENSMUST00000203942 157 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 AC154184.3-201ENSMUST00000225620 1090 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Capsl-202ENSMUST00000226688 739 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ciao1Q99KN2 Rpl3l-201ENSMUST00000045186 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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