Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY4

Trabd, TraB domain-containing protein, mousemouse

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrabdQ99JY4 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Apon-201ENSMUST00000060782 1397 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Nudt13-203ENSMUST00000223663 1633 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Rad18-204ENSMUST00000113182 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
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TrabdQ99JY4 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
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TrabdQ99JY4 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
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TrabdQ99JY4 Gm15507-201ENSMUST00000133523 592 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Gm28038-201ENSMUST00000143119 378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Mfsd11-212ENSMUST00000153084 1194 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Bcl2l12-205ENSMUST00000207755 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Gm45410-201ENSMUST00000211331 1093 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Gm35657-201ENSMUST00000215869 989 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 AC153887.1-201ENSMUST00000219154 1253 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Gm36074-201ENSMUST00000221383 591 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 AC159002.1-201ENSMUST00000226714 924 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Gm13306-201ENSMUST00000098122 418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Rtbdn-202ENSMUST00000109740 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Prdm9-205ENSMUST00000147532 1447 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
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TrabdQ99JY4 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
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TrabdQ99JY4 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
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TrabdQ99JY4 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Arhgap19-204ENSMUST00000177495 1652 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
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TrabdQ99JY4 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
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TrabdQ99JY4 1700039I01Rik-201ENSMUST00000194370 479 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 D5Ertd615e-203ENSMUST00000198493 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
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TrabdQ99JY4 Gm39288-201ENSMUST00000210554 446 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 AC120394.2-201ENSMUST00000213905 702 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Gm4811-201ENSMUST00000220879 1220 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Eny2-204ENSMUST00000226827 558 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Sapcd1-201ENSMUST00000040151 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 1700001K19Rik-201ENSMUST00000070659 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
TrabdQ99JY4 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
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